Prof. Dr. AYCAN GÜNDOĞDU

Metrikler

Yayın

138

Yayın (WoS)

Yayın (Scopus)

Atıf (WoS)

705

H-İndeks (WoS)

Atıf (Scopus)

810

H-İndeks (Scopus)

Atıf (Scholar)

1304

H-İndeks (Scholar)

Proje

Fikri Mülkiyet

Tez Danışmanlığı

Açık Erişim

BM Sürdürülebilir Kalkınma Amaçları

Eğitim Bilgileri

2008 - 2013

Doktora

University of the Sunshine Coast, Avustralya

Yabancı Diller

C2 Ustalık

İngilizce

Araştırma Alanları

Sağlık Bilimleri

Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji

İmmünoloji

Tıbbi Mikrobiyoloji

Biyoinformatik

Mikrobiyoloji

Bakteriyoloji

Akademik Faaliyetlere Dayalı Araştırma Alanları

Avesis Araştırma Alanları

WoS Araştırma Alanları

Scopus Araştırma Alanları

Akademik Ünvanlar / Görevler

2024 - Devam Ediyor

Prof. Dr.

Erciyes Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Temel Tıp Bilimleri

2019 - 2024

Doç. Dr.

Erciyes Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Temel Tıp Bilimleri

2018 - 2019

Dr. Öğr. Üyesi

Erciyes Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Temel Bilimler

2014 - 2018

Yrd. Doç. Dr.

Erciyes Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Temel Bilimler

Yönetilen Tezler

Devam ediyor

Yüksek Lisans

Çoklu Dirençli Acinetobacter baumannii Patojenine Özgü Litik Bakteriyofaj İzolasyonu ve İdentifikasyonu

GÜNDOĞDU A.

P.Yaşar(Öğrenci)

2025

Doktora

İnsan mikrobiyomunda bulunan bakteriyofaj komünitesinin konakçı hastalıklarıyla olan ilişkisinin araştırılması

Gündoğdu A. (Danışman)

M.HORA(Öğrenci)

2025

Yüksek Lisans

KOLİSTİN DİRENÇLİ KLEBSİELLA PNEUMONİAE İÇİN TERAPİ POTANSİYELİ TAŞIYAN LİTİK BAKTERİYOFAJLARIN ARAŞTIRILMASI

Gündoğdu A. (Danışman)

B.ARSLAN(Öğrenci)

2024

Doktora

Marmara Dnizi musilajı ile deniz suyu metagenomunun karşılaştırmalı olarak incelenmesi

Gündoğdu A. (Danışman)

G.KARIŞ(Öğrenci)

2018

Yüksek Lisans

MİKROBİYOM KAYNAKLI ANTİMİKROBİYAL DİRENÇ GENLERİNİN TAKSONOMİK ORJİNLERİNİN TESPİTİ

KILIÇ H. (Eş Danışman), GÜNDOĞDU A.

M.HORA(Öğrenci)

2018

Yüksek Lisans

Klinik Numunelerden İzole Edilen Karbapenem Dirençli Klebsiella pneumoniae Kökenlerinin Rektal Sürüntü Kökenleri ile Karşılaştırılması

GÜNDOĞDU A. (Eş Danışman)

N.Akman(Öğrenci)

2018

Yüksek Lisans

Çocuk ve yetişkin hastaların kan kültürlerinden izole edilen çoklu dirençli E. coli kökenlerinin virülens gen varlığı ve filogenetik grup bakımından karşılaştırılması

GÜNDOĞDU A. (Eş Danışman)

İ.Şen(Öğrenci)

2018

Yüksek Lisans

Yoğun Bakım Ünitelerindeki Çevresel Mikrobiyomun Yeni Nesil Dizileme Teknolojisi İle Araştırılması

GÜNDOĞDU A.

E.Aslan(Öğrenci)

2017

Yüksek Lisans

İmmünmodülatör etkisi olan İnterlökin-10 sitokin geninin klonlanması

GÜNDOĞDU A.

N.Büşra(Öğrenci)

Makaleler

2025

1. Oral and gut microbiota after acromegaly treatment: prospective assessment and insights from machine learning.

Hacioglu A., Karaca Z. C., Urhan E., Demir A. N., Sahin S., Gundogdu A., et al.

Pituitary , cilt.29, sa.1, ss.25, 2025 (SCI-Expanded, Scopus)

2025

2. Deep learning-enhanced wellness scores: A population level study on gut microbiome profiling and health prediction

NALBANTOĞLU Ö. U., Ermis B. H., GÜNDOĞDU A.

BIOMEDICAL SIGNAL PROCESSING AND CONTROL , cilt.110, 2025 (SCI-Expanded, Scopus)

2025

3. Lycopene Supplemented Mediterranean Diet Ameliorates Experimental Autoimmune Encephalomyelitis (EAE) in Mice and Changes Intestinal Microbiome

Atuk Kahraman T., Yılmaz M., Aslan K., Canatan H., Kara A., Nalbantoğlu Ö. U., et al.

Journal of Neuroimmune Pharmacology , cilt.20, sa.1, 2025 (SCI-Expanded, Scopus)

2025

4. From dysbiosis to therapy: Shared gut microbial signatures and targeted interventions across liver, heart and brain disorders

GÜNDOĞDU A., ARIKAN M., Ulaş A., Koldaş S. S., Ece G.

Next Research , 2025 (Hakemli Dergi)

2025

5. Unveiling gut microbiome divergence in sellar-parasellar masses and brain tumors: A link beyond the skull

GÜNDOĞDU A., Nalbantoglu O. U., Ulgen M., Sav M. A., Ekinci G., Kelestimur F., et al.

NEUROSURGICAL REVIEW , cilt.48, sa.1, 2025 (SCI-Expanded, Scopus)

2025

6. Reassessing the promise of NGS in sepsis diagnosis: overcoming scalability barriers

GÜNDOĞDU A.

Future Microbiology , cilt.20, sa.11, ss.707-710, 2025 (SCI-Expanded, Scopus)

2025

7. LONG-TERM IMPACT OF PERSONALIZED MICROBIOME-BASED DIET COMPARED TO LOW-FODMAP DIET ON IBS: A 12-MONTH FOLLOW-UP CLINICAL TRIAL

Tunali V., Arslan N. C., Ermis B. H., Hora M., GÜNDOĞDU A., Nalbantoglu O. U.

GUT , cilt.74, sa.SUPPL_3, 2025 (SCI-Expanded, Scopus)

2025

8. Salmonella serovars in a tertiary hospital in Turkey, 2015-2017: molecular epidemiology, antimicrobial resistance and molecular characteristics of resistance mechanisms

Unalan-Altintop T., Demirci-Duarte S., Koseoglu-Eser O., GÜNDOĞDU A., ÇAKAR A., Gulesen R., et al.

AFRICAN HEALTH SCIENCES , cilt.25, sa.2, ss.70-78, 2025 (SCI-Expanded, Scopus)

2025

9. Exploring the complex interplay of Blastocystis , morbid obesity, and bariatric surgery on gut microbial dynamics

ÖZDEMİR A., Sarzhanov F., DOĞRUMAN AL F., GÜNDOĞDU A., NALBANTOĞLU Ö. U., Yozgat A., et al.

MICROBIAL PATHOGENESIS , cilt.200, 2025 (SCI-Expanded, Scopus)

2025

10. Metabolic and genotypic characterization of meropenem-susceptible and meropenemresistant Serratia marcescens isolates

NİGİZ Ş., HAZIROLAN G., ALTINKANAT GELMEZ G., ÖZKUL KOÇAK C., Kocak E., ERDOĞAN KABLAN S., et al.

TURKISH JOURNAL OF MEDICAL SCIENCES , cilt.55, sa.4, 2025 (SCI-Expanded, Scopus, TRDizin)

2024

11. The comprehensive evaluation of oral and fecal microbiota in patients with acromegaly

ŞAHİN S., GÜNDOĞDU A., NALBANTOĞLU Ö. U., ÖZDAMAR KARACA Z. C., HACIOĞLU A., URHAN M. E., et al.

PITUITARY , cilt.27, ss.555-566, 2024 (SCI-Expanded, Scopus)

2024

12. A Multicenter Randomized Controlled Trial of Microbiome-Based Artificial Intelligence-Assisted Personalized Diet vs Low-Fermentable Oligosaccharides, Disaccharides, Monosaccharides, and Polyols Diet: A Novel Approach for the Management of Irritable Bowel Syndrome

Tunali V., Arslan N. c., Ermis B. H., Hakim G. D., GÜNDOĞDU A., Hora M., et al.

AMERICAN JOURNAL OF GASTROENTEROLOGY , cilt.119, sa.9, ss.1901-1912, 2024 (SCI-Expanded, Scopus)

2024

13. Modulation of the skin and gut microbiome by psoriasis treatment: a comprehensive systematic review

Korneev A., Peshkova M., Koteneva P., GÜNDOĞDU A., Timashev P.

Archives of Dermatological Research , cilt.316, sa.7, 2024 (SCI-Expanded, Scopus)

2024

14. Comparing microbial communities in mucilage and seawater samples: Metagenomic insights into mucilage formation in the Marmara Sea

Gündoğdu A., Nalbantoğlu Ö. U., Karis G., Sarikaya I., Erdogan M. N., Hora M., et al.

ENVIRONMENTAL SCIENCE AND POLLUTION RESEARCH , ss.1-12, 2024 (SCI-Expanded, Scopus)

2024

15. 16S rRNA sequencing reveals microbiota differences in orthopedic implants between aseptic loosening and prosthetic joint infection cases

Cetiner O. F., Hora M., KAFADAR İ. H., Kilic A. U., GÜNDOĞDU A.

ACTA MICROBIOLOGICA ET IMMUNOLOGICA HUNGARICA , cilt.71, sa.2, ss.172-181, 2024 (SCI-Expanded, Scopus)

2024

16. A Shotgun Metagenomics Investigation into Labeling Inaccuracies in Widely Sold Probiotic Supplements in the USA

GÜNDOĞDU A., Karis G., Killpartrick A., ULU KILIÇ A., NALBANTOĞLU Ö. U.

Molecular Nutrition and Food Research , cilt.68, sa.12, 2024 (SCI-Expanded, Scopus)

2024

17. Clonal spread of trimethoprim-sulfamethoxazole-resistant Stenotrophomonas maltophilia isolates in a tertiary hospital

PARKAN Ö. M., KILIÇ H., ALP MEŞE E., Timur D., GÜNDOĞDU A., Unaldi O., et al.

GMS HYGIENE AND INFECTION CONTROL , cilt.19, 2024 (ESCI)

2023

18. A toolbox of machine learning software to support microbiome analysis

Zambrano L. J. M., Molina V. M. L., Bakir-Gungor B., Frohme M., Karaduzovic-Hadziabdic K., Klammsteiner T., et al.

FRONTIERS IN MICROBIOLOGY , cilt.14, ss.1-9, 2023 (SCI-Expanded, Scopus)

2023

19. The role of the Mediterranean diet in modulating the gut microbiome: A review of current evidence

GÜNDOĞDU A., NALBANTOĞLU Ö. U.

Nutrition , cilt.114, 2023 (SCI-Expanded, Scopus)

2023

20. Metagenomic Profiling of Human Protozoan Parasites in Wastewater and Hospital Effluents

GÜNDOĞDU A., Charyyeva A., NALBANTOĞLU Ö. U.

JOURNAL OF CLINICAL PRACTICE AND RESEARCH , cilt.45, sa.5, ss.435-446, 2023 (ESCI, TRDizin)

2023

21. Potential associations between alterations in gut microbiome and obesity-related traits after the bariatric surgery

ÖZDEMİR A., Yozgat A., Isgin-Atici K., Avci E., Yildiz B. D., GÜNDOĞDU A., et al.

JOURNAL OF HUMAN NUTRITION AND DIETETICS , cilt.36, sa.3, ss.981-996, 2023 (SCI-Expanded, Scopus)

2023

22. Culture-independent assessment of probiotic supplement consistency in commercially available probiotic supplements

GÜNDOĞDU A., NALBANTOĞLU Ö. U., Sarikaya I., Karis G., Erdogan M. N., Hora M., et al.

Food Bioscience , cilt.53, 2023 (SCI-Expanded, Scopus)

2022

23. Artificial intelligence-based personalized diet: A pilot clinical study for irritable bowel syndrome

Karakan T., Gündoğdu A., Alagözlü H., Ekmen N., Özgül S., Tunalı V., et al.

GUT MICROBES , cilt.14, sa.1, ss.1-13, 2022 (SCI-Expanded, Scopus)

2022

24. Efficacy of AI-Assisted Personalized Microbiome Modulation by Diet in Functional Constipation: A Randomized Controlled Trial

Arslan N. Ç., GÜNDOĞDU A., Tunali V., Topgül O. H., Beyazgül D., NALBANTOĞLU Ö. U.

Journal of Clinical Medicine , cilt.11, sa.22, 2022 (SCI-Expanded, Scopus)

2022

25. SERS-based sensor with a machine learning based effective feature extraction technique for fast detection of colistin-resistant Klebsiella pneumoniae

Ciloglu F., Hora M., GÜNDOĞDU A., Kahraman M., TOKMAKÇI M., AYDIN Ö.

Analytica Chimica Acta , cilt.1221, 2022 (SCI-Expanded, Scopus)

2022

26. Acromegaly is associated with a distinct oral and gut microbiota

Sahin S., GÜNDOĞDU A., NALBANTOĞLU Ö. U., KADIOĞLU P., ÖZDAMAR KARACA Z. C., HACIOĞLU A., et al.

PITUITARY , cilt.25, sa.3, ss.520-530, 2022 (SCI-Expanded, Scopus)

2022

27. A comparative study of the clonal diversity and virulence characteristics of uropathogenic Escherichia coli isolated from Australian and Turkish (Turkey) children and adults with urinary tract infections

Astley D. J., Spang L., Parnian F., Vollmerhausen T., Kılıç H., Hora M., et al.

GERMS , cilt.12, sa.2, ss.214-230, 2022 (ESCI, Scopus)

2022

28. Stratification of the Gut Microbiota Composition Landscape across the Alzheimer's Disease Continuum in a Turkish Cohort

YILDIRIM S., NALBANTOĞLU Ö. U., Bayraktar A., Ercan F. B., GÜNDOĞDU A., Velioglu H. A., et al.

MSYSTEMS , cilt.7, sa.1, 2022 (SCI-Expanded, Scopus)

2021

29. Temporal overexpression of IL-22 and Reg3 gamma differentially impacts the severity of experimental autoimmune encephalomyelitis

Eken A., Erdem S., Haliloglu Y., Okus F. Z., Cakir M., Yetkin M. F., et al.

IMMUNOLOGY , cilt.164, sa.1, ss.73-89, 2021 (SCI-Expanded, Scopus)

2021

30. Gut microbiota in patients with newly diagnosed acromegaly: a pilot cross-sectional study

HACIOĞLU A., GÜNDOĞDU A., Nalbantoglu U., Karaca Z. C., URHAN M. E., Sahin S., et al.

PITUITARY , cilt.24, sa.4, ss.600-610, 2021 (SCI-Expanded, Scopus)

2021

31. Synthesis of pyrrolo[3,2-c]carbazole-2-carbohydrazides and pyrrolo[3,2-c]carbazol-2-yl-1,3,4-oxadiazoles and their in vitro antibacterial evaluation

Sağlam M. F., Gündoğdu A., Hora M., Kandemir H., Şengül İ. F.

Synthetic Communications , ss.1-11, 2021 (SCI-Expanded, Scopus)

2021

32. ARTIFICIAL INTELLIGENCE-BASED PERSONALISED DIET: A PILOT CLINICAL STUDY FOR IBS

Karakan T., Gündoğdu A., Alagözlü H., Ekmen N., Kılıç G., Özgül S., et al.

Gastroenterology , cilt.160, sa.6, ss.99-100, 2021 (SCI-Expanded, Scopus)

2021

33. Statistical and Machine Learning Techniques in Human Microbiome Studies: Contemporary Challenges and Solutions

Moreno-Indias I., Lahti L., Nedyalkova M., Elbere I., Roshchupkin G., Adilovic M., et al.

Frontiers in Microbiology , cilt.12, sa.635781, ss.1-9, 2021 (SCI-Expanded, Scopus)

2020

34. Effect of essential oil supplementation to diet on meat quality, fatty acid composition, performance parameters and intestinal microbiota of Japanese quails

Kürekçi C., Özsoy B., Hassan E., Özkan H., Gündoğdu A., Özsoy Ş. Y., et al.

Journal Of Animal Physiology And Animal Nutrition , ss.1-11, 2020 (SCI-Expanded, Scopus)

2020

35. COVID-19 Pandemic: Group Testing

Nalbantoğlu Ö. U., Gündoğdu A.

FRONTIERS IN MEDICINE , cilt.7, 2020 (SCI-Expanded, Scopus)

2019

36. Rapid detection of difficult-to-culture bacterial pathogens using real-time nanopore sequencing

GÜNDOĞDU A., ULU KILIÇ A., KILIÇ H., NALBANTOĞLU Ö. U.

Infectious Diseases and Clinical Microbiology , cilt.1, sa.3, ss.128-133, 2019 (TRDizin)

2019

37. Presence of OXA-48 Gene in a Clinical Isolate of Lactobacillus rhamnosus

HAZIROLAN G., GÜNDOĞDU A., Nigiz S., ALTUN B., GÜR D.

FOODBORNE PATHOGENS AND DISEASE , cilt.16, sa.12, ss.840-843, 2019 (SCI-Expanded, Scopus)

2019

38. Mikrobiyom Modülasyonunda Kişiselleştirilmiş Probiyotik İhtiyacı

Gündoğdu A.

Tıp Fakültesi Klinikleri Dergisi , cilt.2, sa.3, ss.79-82, 2019 (Hakemli Dergi)

2018

39. The first report of mobile colistin resistance gene (mcr-1) carrying Escherichia coli in Turkey

KUREKCI C., AYDIN M., NALBANTOĞLU Ö. U., GÜNDOĞDU A.

JOURNAL OF GLOBAL ANTIMICROBIAL RESISTANCE , cilt.16, 2018 (SCI-Expanded, Scopus)

2018

40. Bacteriophage Therapy: An Unforgetten Source of Cure

GÜNDOĞDU A., ULU KILIÇ A.

KLIMIK JOURNAL , cilt.31, sa.2, ss.78-87, 2018 (ESCI, Scopus, TRDizin)

2018

41. Could Frequent Carbapenem Use Be a Risk Factor for Colistin Resistance?

GÜNDOĞDU A., Ulu-Kilic A., KILIÇ H., OZHAN E., ALTUN D., CAKIR O., et al.

MICROBIAL DRUG RESISTANCE , sa.6, ss.774-781, 2018 (SCI-Expanded, Scopus)

2018

42. An outbreak of bloodstream infection due to extensively resistant Acinetobacter baumannii among neonates

Ulu-Kilic A., GÜNDOĞDU A., CEVAHİR F., KILIÇ H., GÜNEŞ T., Alp E.

AMERICAN JOURNAL OF INFECTION CONTROL , cilt.46, sa.2, ss.154-158, 2018 (SCI-Expanded, Scopus)

2017

43. Characterization of extended spectrum beta-lactamase ( ESBL)-producing Escherichia coli in Asi (Orontes) River in Turkey

Kurekci C., Aydin M., Yipel M., KATOULI M., GÜNDOĞDU A.

JOURNAL OF WATER AND HEALTH , cilt.15, sa.5, ss.788-798, 2017 (SCI-Expanded, Scopus)

2017

44. Distribution and Antimicrobial Resistance of Salmonella Serovars Isolated in Kayseri Region

GÜNDOĞDU A., KILIÇ H., Ulu-Kilic A., Parkan O. M., TURE Z.

KLIMIK JOURNAL , cilt.30, sa.1, ss.22-26, 2017 (ESCI, Scopus, TRDizin)

2017

45. Human genome-microbiome interaction: metagenomics frontiers for the aetiopathology of autoimmune diseases

GÜNDOĞDU A., Nalbantoglu U.

MICROBIAL GENOMICS , cilt.3, sa.4, 2017 (SCI-Expanded, Scopus)

2016

46. Bir Süper Organizma Olarak İnsan; Mikrobiyomun Genetik Kontrolü

GÜNDOĞDU A.

TÜRK MİKROBİYOLOJİ CEMİYETİ DERGİSİ , cilt.46, sa.4, ss.147-151, 2016 (TRDizin)

2016

47. Humans as a source of colistin resistance: In silico analysis of public metagenomes for the mcr-1 gene in the gut microbiome

GÜNDOĞDU A., NALBANTOĞLU Ö. U.

Erciyes Tip Dergisi , cilt.38, sa.2, ss.59-61, 2016 (ESCI, Scopus)

2016

48. Characterisation of Phenotypic and Genotypic Antibiotic Resistance Profile of Enterococci from Cheeses in Turkey

Kurekci C., Onen S. P., Yipel M., Aslantas O., GÜNDOĞDU A.

KOREAN JOURNAL FOR FOOD SCIENCE OF ANIMAL RESOURCES , cilt.36, sa.3, ss.352-358, 2016 (SCI-Expanded, Scopus)

2016

49. Susceptibilities of Multidrug-Resistant Pathogens Responsible for Complicated Skin and Soft Tissue Infections to Standard Bacteriophage Cocktails

Gündoğdu A., Kılıç H., Kilic A., Kutateladze M.

MIKROBIYOLOJI BULTENI , cilt.50, ss.215-223, 2016 (SCI-Expanded, Scopus, TRDizin)

2016

50. Pediyatrik Hastalarda Nozokomiyal Kan Dolaşımı İnfeksiyonlarının Epidemiyolojik Özellikleri

GÜNDOĞDU A., KILIÇ H., ULU KILIÇ A., Aydın G., ALP MEŞE E.

KLİMİK DERGİSİ , cilt.29, ss.29-35, 2016 (Scopus, TRDizin)

2016

51. In vitro Effectiveness of Commercial Bacteriophage Cocktails on Diverse Extended Spectrum Beta Lactamase Producing Escherichia coli Strains

Gündoğdu A., Bolkvadze D., Kılıç H.

Frontiers in Microbiology , cilt.1, sa.1761, ss.1-8, 2016 (SCI-Expanded, Scopus)

2016

52. Epidemiological features of nosocomial bloodstream infections in pediatric patients

Gündoğdu A., Kılıç H., Ulu Kılıç A., Aydın G., Alp Meşe E.

Klimik Dergisi , cilt.29, ss.29-35, 2016 (Scopus, TRDizin)

2016

53. Human Being as a “Superorganism” Genetic Control of Microbiome

GÜNDOĞDU A.

Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi , cilt.46, sa.4, ss.147-151, 2016 (TRDizin)

2015

54. Antibiyotik Çağı Sonunda Keşfedilen Yeni Dünyalar: Rezistom ve Mobilom

Gündoğdu A., Alp Meşe E.

FLORA INFEKSIYON HASTALIKLARI VE KLINIK MIKROBIYOLOJI DERGISI , cilt.20, sa.4, ss.167-173, 2015 (ESCI)

2013

55. Extended-spectrum beta-lactamase producing Escherichia coli in hospital wastewaters and sewage treatment plants in Queensland, Australia

Guendogdu A., JENNISON A. V., SMITH H. V., STRATTON H., KATOULI M.

CANADIAN JOURNAL OF MICROBIOLOGY , cilt.59, sa.11, ss.737-745, 2013 (SCI-Expanded, Scopus)

2013

56. Antibiotic resistant Staphylococcus aureus in hospital wastewaters and sewage treatment plants with special reference to methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA)

THOMPSON J. M., Guendogdu A., STRATTON H. M., KATOULI M.

JOURNAL OF APPLIED MICROBIOLOGY , cilt.114, sa.1, ss.44-54, 2013 (SCI-Expanded, Scopus)

2012

57. Prevalence and pathogenesis of extended-spectrum beta-lactamase producing Escherichia coli causing urinary tract infection in hospitalized patients

Guendogdu A., LONG Y. B., KATOULI M.

EUROPEAN JOURNAL OF CLINICAL MICROBIOLOGY & INFECTIOUS DISEASES , cilt.31, sa.11, ss.3107-3116, 2012 (SCI-Expanded, Scopus)

2011

58. Antimicrobial resistance and distribution of sul genes and integron-associated intl genes among uropathogenic Escherichia coli in Queensland, Australia

Guendogdu A., LONG Y. B., VOLLMERHAUSEN T. L., KATOULI M.

JOURNAL OF MEDICAL MICROBIOLOGY , cilt.60, sa.11, ss.1633-1642, 2011 (SCI-Expanded, Scopus)

2011

59. Population structure and uropathogenic virulence-associated genes of faecal Escherichia coli from healthy young and elderly adults

VOLLMERHAUSEN T. L., RAMOS N. L., Guendogdu A., ROBINSON W., BRAUNER A., KATOULI M.

JOURNAL OF MEDICAL MICROBIOLOGY , cilt.60, sa.5, ss.574-581, 2011 (SCI-Expanded, Scopus)

2010

60. Prevalence and Persistence of Escherichia coli Strains with Uropathogenic Virulence Characteristics in Sewage Treatment Plants

ANASTASI E. M., MATTHEWS B., Gundogdu A., VOLLMERHAUSEN T. L., RAMOS N. L., STRATTON H., et al.

APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY , cilt.76, sa.17, ss.5882-5886, 2010 (SCI-Expanded, Scopus)

Hakemli Bilimsel Toplantılarda Yayımlanmış Bildiriler

2025

1. DEPREM AFETI SONRASI KAHRAMANMARAŞ’TA İÇME SULARINDA GÖRÜLEN ARTAN BULANIKLIK SEVIYESININ SULARDAKI BAKTERIYEL YÜKLE İLIŞKISININ İNCELENMESI

MUTLU SARIGÜZEL F., GÜNDOĞDU A., BORLU A., Özbebek H. T., ORAK F., KAYA E., et al.

8. ULUSAL KLİNİK MİKROBİYOLOJİ KONGRESİ, Antalya, Türkiye, 19 Kasım 2025, (Özet Bildiri)

2023

2. Klinik Apse Örneklerine Ait Anaerobik Bakteri Çeşitliliğinin Yeni Nesil Dizleme ve Konvansiyonel Yöntemler Üzerinden Karşılaştırmalı Olarak İncelemesi

Oskay M., MUTLU SARIGÜZEL F., Hora m., GÜNDOĞDU A.

7. Ulusal Klinik Mikrobiyolojı Kongresi 4. ulusal viroloji günleri 1-5 Kasım 2023, Bodrum, Türkiye, 01 Kasım 2023, cilt.1, ss.46-48, (Özet Bildiri)

2022

3. Hematolojik Malignensisi Olan Hastalarda Karbapenem Dirençli Gram-olumsuz Enfeksiyonlar için Risk Faktörlerinin Belirlenmesi

DÖRTERLER S. M., ULU KILIÇ A., ZARARSIZ G., GÜNDOĞDU A., TÜRE YÜCE Z.

10. TÜRKİYE EKMUD BİLİMSEL KONGRESİ, Türkiye, 25 Mayıs 2022, (Özet Bildiri)

2021

4. Detection of colistin resistant Klebsiella pneumoniae bacteria using surfaceenhanced Raman spectroscopy combined with machine learning

UYSAL F., Hora M., GÜNDOĞDU A., TOKMAKÇI M., AYDIN Ö.

BIO Türkiye Organizasyonu Uluslararası Biyoteknoloji Kongresi, Türkiye, 9 - 11 Eylül 2021, (Tam Metin Bildiri)

2019

5. De novo mutations in lipopolysaccharide biosynthesis pathways reveal thecolistin resistance mechanism in Acinetobacter baumannii strains

ULU KILIÇ A., GÜNDOĞDU A., NALBANTOĞLU Ö. U., ASLAN E.

29th ECCMID, 13 - 17 Nisan 2019, (Tam Metin Bildiri)

2019

6. In silico discovery of antibiotic resistance patterns and artificialintelligence-based decision support systems for rational drug use

ULU KILIÇ A., GÜNDOĞDU A., NALBANTOĞLU Ö. U.

29TH ECCMID, 13 - 16 Nisan 2019, (Özet Bildiri)

2019

7. Atypical pathobiome of prosthetic joint infections revealed by hybrid approaches of shotgun metagenomics

ULU KILIÇ A., GÜNDOĞDU A., NALBANTOĞLU Ö. U., KAFADAR İ. H., GÜNEY A., KILIÇ H., et al.

29th ECCMID, 13 - 16 Nisan 2019, (Tam Metin Bildiri)

2019

8. Patojenlerin Hızlı Tespitinde Gerçek Zamanlı Nanopor Dizileme Teknolojisinin Kullanımı

GÜNDOĞDU A., ULU KILIÇ A., TÜRE YÜCE Z., KILIÇ H., NALBANTOĞLU Ö. U.

7. TÜRKİYE EKMUD BİLİMSEL PLATFORMU, Antalya, Türkiye, 03 Nisan 2019, (Özet Bildiri)

2019

9. Mikrobiyom Çalışmalarında Laboratuvar Süreçleri ve Translasyonel Yaklaşımlar

GÜNDOĞDU A.

7. Pediatrik Probiyotik Prebiyotik Akademisi, Antalya, Türkiye, 21 - 24 Şubat 2019, ss.25-27, (Tam Metin Bildiri)

2018

10. The taxonomic origins of the antimicrobial resistance genes present in hot-spot environments.

HORA M., GÜNDOĞDU A., KILIÇ H.

38. Türk mikrobiyoloji cemiyeti kongresi, Antalya, Türkiye, 4 - 08 Kasım 2018, ss.21, (Tam Metin Bildiri)

2018

11. KAN KÜLTÜRÜNDE ÜREYEN RALSTONİA MANNİTOLİLYTİCA ÜZERİNE TÜM GENOM TEMELLİ BİR ÇALIŞMA :YAKIN ZAMANDA KAZANILMIŞ VİRÜLANS ADALARININ TESPİTİ

NALBANTOĞLU Ö., KILIÇ H., ULU KILIÇ A., HORA M., GÜNDOĞDU A.

38. Türk mikrobiyoloji cemiyeti kongresi, Antalya, Türkiye, 4 - 08 Kasım 2018, ss.39, (Tam Metin Bildiri)

2018

12. Potential antimicrobials fighting XDR-pathogens A study on the isolation and characterization of lytic bacteriophages effective on colistin resistance K. pneumoniae

GÜNDOĞDU A., ULU KILIÇ A., ARSLAN B., KILIÇ H.

ESCMID/ASM Conference on Drug Development to Meet the Challenge of Antimicrobial Resistance, 4 - 07 Eylül 2018, (Özet Bildiri)

2018

13. Antimicrobial resistance, genomic and molecular epidemiologic analysis of Salmonella serovars in Hacettepe University Hospitals

Ünalan T., Demirci S., Eser Ö., GÜNDOĞDU A., Çakar A., Güleşen R., et al.

ESCMID/ASM Conference on Drug Development to Meet the Challenge of Antimicrobial Resistance, Lizbon, Portekiz, 4 - 07 Eylül 2018, ss.34, (Tam Metin Bildiri)

2018

14. Comparison of Gut Microbiota in Patients of Mild-Cognitive Impairment and Alzheimer’s Diseasewith Age and Sex Matched Normal Controls: A Multicenter Study.

NALBANTOĞLU Ö. U., Sezgin B., GÜNDOĞDU A., Koç F., GÖL M. F., Hanoğlu L., et al.

The 7th annual International Human Microbiome Consortium Meeting (IHMC2018), Killarney, İrlanda, 26 - 28 Haziran 2018, ss.165, (Tam Metin Bildiri)

2018

15. Limited sensitivity andenrichment bias of culture-based pathogen detection in intensive care unit enviroment revealed by metagenomic sequence

Gündoğdu A., Kilic H., Ulu Kilic A., Gündoğan K., Aslan E., Ufuk N.

ESCMID Madrid,Spain 21-24 april 2018, Madrid, İspanya, 21 - 24 Nisan 2018, ss.116, (Tam Metin Bildiri)

2018

16. Microbiome Network Analysis Reveals Highly Symbiotic Interaction of Core Metabolic Pathways

Taylan B., GÜNDOĞDU A., NALBANTOĞLU Ö. U.

2nd International Human Microbiota: In health and diseases congress, Antalya, Türkiye, 18 - 22 Nisan 2018, ss.95, (Tam Metin Bildiri)

2018

17. Towards Microbiome-Based Liquid Biopsy: Oral Microbiota Harbors Highly Accurate Biomarkers of Lung Cancer

GÜNDOĞDU A., NALBANTOĞLU Ö. U., ÖNAL Ö., Önal M. G.

2nd International Human Microbiota: In health and diseases congress, Antalya, Türkiye, 18 - 22 Nisan 2018, ss.60-61, (Tam Metin Bildiri)

2018

18. Persistence of Microbial Communities in the Hospital Environment

Aslan-Gürpınar E., NALBANTOĞLU Ö. U., KILIÇ H., ULU KILIÇ A., GÜNDOĞAN K., GÜNDOĞDU A.

2nd International Human Microbiota: In health and diseases congress, Antalya, Türkiye, 18 - 22 Nisan 2018, ss.44, (Tam Metin Bildiri)

2018

19. Resistome

GÜNDOĞDU A.

2nd International Human Microbiota: In health and diseases congress, Antalya, Türkiye, 12 - 22 Nisan 2018, ss.2, (Tam Metin Bildiri)

2018

20. General Compositional Trends in Human Gut Microbiome: Diverse Phylogenetic Profiles Converge in Function According to Latent Structure Analysis

Elgun U. G., GÜNDOĞDU A., NALBANTOĞLU Ö. U.

2nd International Human Microbiota: In health and diseases congress, Antalya, Türkiye, 18 - 22 Nisan 2018, ss.62, (Tam Metin Bildiri)

2018

21. Biomarkers of Diseases in Human Microbiome-Practice

GÜNDOĞDU A.

The 2nd International Congress on Human Microbiota and Health Effects, Antalya, Türkiye, 18 - 22 Nisan 2018, ss.37, (Tam Metin Bildiri)

2018

22. Turkish Microbes: Previously Non-Catalogued Genes Were Detected in the Gut Metagenomes of Turkish Individuals

Hora M., Yalçın K., GÜNDOĞDU A.

2nd International Human Microbiota: In health and diseases congress, Antalya, Türkiye, 18 - 22 Nisan 2018, ss.59, (Tam Metin Bildiri)

2018

23. Gut Microbiota Dysbiosis in Substance Use Disorders and Its Partial Recovery by Detoxification Treatment is Revealed by 16S rRNA Gene Deep Sequencing

Kargin M., Celebi E., NALBANTOĞLU Ö. U., GÜNDOĞDU A.

2nd International Human Microbiota: In health and diseases congress, Antalya, Türkiye, 18 - 22 Nisan 2018, ss.83, (Tam Metin Bildiri)

2018

24. Should Bacterial Etiologies Be Considered in Aseptic Loosening?

GÜNDOĞDU A., NALBANTOĞLU Ö. U., ULU KILIÇ A., KAFADAR I. H., GÜNEY A., KILIÇ H.

2nd International Human Microbiota: In health and diseases congress, Antalya, Türkiye, 18 - 22 Nisan 2018, ss.71, (Tam Metin Bildiri)

2018

25. Accurate Classification and Biomarker Discovery in Disease Microbiome Using a Novel De Novo Bioinformatics Approach

NALBANTOĞLU Ö. U., Yalçın K., GÜNDOĞDU A.

2nd International Human Microbiota: In health and diseases congress, Antalya, Türkiye, 18 - 22 Nisan 2018, ss.63, (Tam Metin Bildiri)

2018

26. Whole-genome sequencing reveals recently acquired virulence islands in Ralstonia mannitolilytica isolated from high-risk patients

NALBANTOĞLU Ö. U., KILIÇ H., ULU KILIÇ A., Hora M., GÜNDOĞDU A.

28th European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases8th European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, Madrid, İspanya, 21 Nisan 2018, ss.1765, (Tam Metin Bildiri)

2018

27. Comparison of antimicrobial resistance-gene diversity in gut microbiome of healthy individuals from Turkey, Europe, America and China

GÜNDOĞDU A., Yalçın K., ULU KILIÇ A., Saka S., NALBANTOĞLU Ö. U.

28th European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases8th European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, Madrid, İspanya, 21 Nisan 2018, ss.1512, (Tam Metin Bildiri)

2018

28. Mobil Kolistin Direncinin Türkiye Rezistom Ekosistemindeki İlk Sinyalleri: Besin Kaynaklı E. coli Suşlarında mcr-1 Geninin Tespiti

KUREKCI C., AYDIN M., NALBANTOĞLU Ö. U., GÜNDOĞDU A.

13. Antimikrobik Kemoterapi Günleri, İstanbul, Türkiye, 6 - 08 Nisan 2018, ss.88, (Özet Bildiri)

2018

29. İnsan ve Çevre Mikrobiyomunda Rezistom-Mobilom Döngüleri

GÜNDOĞDU A.

13. Antimikrobik Kemoterapi Günleri, İstanbul, Türkiye, 6 - 08 Nisan 2018, ss.20, (Tam Metin Bildiri)

2018

30. Atık ve Arıtılmış Sularda Karbapenem Dirençli Genişlemiş Spektrumlu Beta-Laktamaz Üreten E. coli Üzerine Bir Çalışma

Aslan-Gülpınar E., GÜNDOĞDU A.

13. Antimikrobik Kemoterapi Günleri, İstanbul, Türkiye, 06 Nisan 2018, ss.153, (Tam Metin Bildiri)

2018

31. Klinik Metagenomiğin Vaadleri ve Problemleri

GÜNDOĞDU A.

XIX. Türk Klinik Mikrobiyoloji ve İnfeksiyon Hastalıkları Kongresi, Antalya, Türkiye, 28 - 31 Mart 2018, ss.1, (Tam Metin Bildiri)

2018

32. Oral mikrobiyomdan potansiyel karaciğer kanseri biyobelirteçlerinin Keşfi

Yalçın K., GÜNDOĞDU A., NALBANTOĞLU Ö. U.

3. Yaşam Bilimleri Kongresi, Kayseri, Türkiye, 24 - 25 Şubat 2018, ss.1, (Tam Metin Bildiri)

2018

33. Nanogözenek DNA dizilemede kullanılan baz çağırma yazılımlarının performans analizi

Saka S., Hora M., Yalçın K., GÜNDOĞDU A., NALBANTOĞLU Ö. U.

3. Yaşam Bilimleri Kongresi, Kayseri, Türkiye, 23 - 24 Şubat 2018, ss.1, (Tam Metin Bildiri)

2018

34. Parkinson Hastalığında Bağırsak Mikrobiyomu Değişikliklerinin in silico incelenmesi

Hora M., Yalçın K., Saka S., NALBANTOĞLU Ö. U., GÜNDOĞDU A.

3. Yaşam Bilimleri Kongresi, Kayseri, Türkiye, 23 - 24 Şubat 2018, ss.1, (Tam Metin Bildiri)

2017

35. Metagenomik Analizler Üzerinden Sağlıklı İnsan Bağırsağındaki Rezistom Çeşitliliğinin Ortaya Çıkarılması

GÜNDOĞDU A., NALBANTOĞLU Ö. U., YALÇIN K.

4. Ulusal Klinik Mikrobiyoloji Kongresİ, Türkiye, 8 - 12 Kasım 2017, (Özet Bildiri)

2017

36. METAGENOMIK ANALIZLER ÜZERIDEN SAGLIKLI INSAN BAGIRSAGINDAKI REZISTOM ÇESITLILIGININ ORTAYA ÇIKARILMASI

GÜNDOĞDU A., NALBANTOĞLU Ö. U., Yalçın K.

4. Ulusal Klinik Mikrobiyoloji Kongresi, Antalya, Türkiye, 8 - 12 Kasım 2017, ss.208-209, (Tam Metin Bildiri)

2017

37. Kolistin Dirençli K. pneumoniae’ya Etkili Litik Bakteriyofaj İzolasyonu Ve Karakterizasyonu

GÜNDOĞDU A., ULU KILIÇ A., KILIÇ H., Arslan B.

4. Ulusal Klinik Mikrobiyoloji Kongresi, Türkiye, 8 - 12 Kasım 2017, (Özet Bildiri)

2017

38. Kültür Bağımlı ve Kültür Bağımsız Yöntemler İle Yoğun Bakım Ünitesi Çevresel Flora Analizi

GÜNDOĞDU A., KILIÇ H., ULU KILIÇ A., Gürpınar E. A., NALBANTOĞLU Ö. U.

4. Ulusal Klinik Mikrobiyoloji Kongresi, Antalya, Türkiye, 8 - 12 Kasım 2017, (Özet Bildiri)

2017

39. Phage therapy: An alternative treatment option for bacterial infections caused by extensively-drug resistant pathogens

GÜNDOĞDU A.

International Conference and Expo on Clinical Virology and Infectious Diseases, Houston, Amerika Birleşik Devletleri, 18 - 19 Eylül 2017, ss.3, (Tam Metin Bildiri)

2017

40. Bacteriophage as an effective decolonizing agent for Staphylococcus aureus carriers

ULU KILIÇ A., GÜNDOĞDU A., KILIÇ H., ALP MEŞE E.

FEMS2017, 9 - 13 Temmuz 2017, (Özet Bildiri)

2017

41. A NEW COLISTIN RESISTANCE GENE HOMOLOGOUS FOUND IN WASTEWATER METAGENOME

GÜNDOĞDU A., Önal M. G., ULU KILIÇ A., NALBANTOĞLU Ö. U.

The 7th Congress of European Microbiologists (FEMS 2017), Valensiya, İspanya, 9 - 13 Temmuz 2017, ss.1998, (Tam Metin Bildiri)

2017

42. Human Protozoan Parasite Diversity In Waste and Treated Water: An Environmental Metagenomics Analysis

GÜNDOĞDU A., CHARYEVA A., KILIÇ H., NALBANTOĞLU Ö. U.

7th Congress of European Microbiologists (FEMS2017), 9 - 13 Temmuz 2017, (Özet Bildiri)

2017

43. Antibacterial Activity of Nonwoven Cleaning Materials Treated with Silver Nanoparticles after New Developed Repeated Washing Process

ÇİNÇİK E., GÜNDOĞDU A., YILDIZ S. C.

Fiber Society 2017 Spring Conference, Aachen, Almanya, 17 - 19 Mayıs 2017, ss.81, (Özet Bildiri)

2017

44. Rapid pathogen detection in ambiguous infections using real-time nanopore sequencing technology

GÜNDOĞDU A., KILIÇ H., ULU KILIÇ A., NALBANTOĞLU Ö. U.

27th European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, 22 - 25 Nisan 2017, (Özet Bildiri)

2017

45. An alternative vancomycin resistant enterococci decolonization strategy: bacteriophage therapy

ULU KILIÇ A., GÜNDOĞDU A., KILIÇ H., ALP MEŞE E.

27th European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases7th European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, 22 - 25 Nisan 2017, (Özet Bildiri)

2017

46. Molecular characterization of clinical Stenotrophomonas maltophilia isolates from a tertiary care hospital in Kayseri, Turkey

PARKAN Ö. M., KILIÇ H., GÜNDOĞDU A., ALP MEŞE E., TİMUR D., Ünaldı Ö., et al.

27th European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases (ECCMID), Viyana, Avusturya, 22 - 25 Nisan 2017, ss.2910, (Tam Metin Bildiri)

2017

47. A high resistome diversity in a metropolitan hospital wastewater in Turkey revealed using shotgun metagenomics

GÜNDOĞDU A., NALBANTOĞLU Ö. U., KILIÇ H.

27th European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, 22 - 25 Nisan 2017, (Özet Bildiri)

2017

48. Bir Süper Organizma Olarak İnsan: Mikrobiyom ve Metagenom

GÜNDOĞDU A.

TÜBA-Mikrobiyota ve İnsan Sağlığı Sempozyumu, Ankara, Türkiye, 10 Nisan 2017, ss.1, (Tam Metin Bildiri)

2016

49. Plasmids with a potential of pandrug resistance coding found in human gut microbiome

GÜNDOĞDU A., NALBANTOĞLU Ö. U.

The 6th annual International Human Microbiome Consortium Congress, Houston, Amerika Birleşik Devletleri, 8 - 11 Kasım 2016, ss.36, (Tam Metin Bildiri)

2016

50. Strain level pathogen detection in metagenomic samples using posterior profile corrections

NALBANTOĞLU Ö. U., GÜNDOĞDU A.

The 6th annual International Human Microbiome Consortium Congress, Houston, Amerika Birleşik Devletleri, 8 - 11 Kasım 2016, ss.41, (Tam Metin Bildiri)

2016

51. Komplike Deri ve Yumuşak Doku Enfeksiyon Etkeni Patojenlerin Standart-faj Duyarlılıkları

GÜNDOĞDU A., KILIÇ H., Kutateladze M., ULU KILIÇ A.

6. TÜRKİYE EKMUD KONGRESİ, Antalya, Türkiye, 11 - 15 Mayıs 2016, ss.25, (Özet Bildiri)

2016

52. Kolistin Dirençli Gram-olumsuz Mikroorganizmaların Klinik ve Epidemiyolojisi: Hastanelerde Yeni Tehdit

GÜNDOĞDU A., ULU KILIÇ A., KILIÇ H., ALP MEŞE E.

6. TÜRKİYE EKMUD KONGRESİ, Antalya, Türkiye, 11 - 15 Mayıs 2016, ss.37, (Özet Bildiri)

2016

53. Toplum Kaynaklı Üropatojenik Escherichia coli Kökenlerinde Patojenite Değerlendirilmesi

GÜNDOĞDU A., KILIÇ H., ASTLEY D., KATOULİ M.

6. TÜRKİYE EKMUD KONGRESİ, Türkiye, 11 - 15 Mayıs 2016, (Özet Bildiri)

2016

54. Standart bakteriyofaj kokteyllerinin VRE patojenlerine karşı in vitro aktivitelerinin araştırılması

ULU KILIÇ A., GÜNDOĞDU A., KILIÇ H., ALP MEŞE E.

6. TÜRKİYE EKMUD KONGRESİ, Antalya, Türkiye, 11 - 15 Mayıs 2016, ss.20, (Özet Bildiri)

2016

55. Ayakta Hastalardan İzole Edilen Dirençli Shigella Kökenlerinde Sul/İnt gen Dağılımları

GÜNDOĞDU A., KILIÇ H., PARKAN Ö. M., Arslan B.

6. TÜRKİYE EKMUD KONGRESİ, Antalya, Türkiye, 11 - 15 Mayıs 2016, ss.72, (Tam Metin Bildiri)

2016

56. Human as a source of colistin resistance: presence of the mcr-1 gene in the gut microbiome

GÜNDOĞDU A., NALBANTOĞLU Ö. U.

26th European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, Amsterdam, Hollanda, 9 - 12 Nisan 2016, (Tam Metin Bildiri)

2016

57. Clonal diversity and virulence characteristics of UPEC strains with their adhesion capability on Caco-2 and A-498 cell lines

GÜNDOĞDU A., KILIÇ H., Astley D., KATOULI M.

26th European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, Amsterdam, Hollanda, 9 - 12 Nisan 2016, ss.192, (Tam Metin Bildiri)

2016

58. Susceptibility of ESBL-producing Escherichia coli to commercial bacteriophage coctails originated in Georgia

GÜNDOĞDU A., KILIÇ H., Bolkvadze D.

26th European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, Amsterdam, Hollanda, 9 - 12 Nisan 2016, ss.153, (Tam Metin Bildiri)

2016

59. Sewage treatment plants cause artifical selection of ESBL-producing E. coli threatening public health

GÜNDOĞDU A., KILIÇ H., ALP MEŞE E.

26th European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, Amsterdam, Hollanda, 9 - 12 Nisan 2016, ss.45, (Tam Metin Bildiri)

2016

60. Colistin resistant Gram negative pathogens lacking the mcr 1 gene isolated from clinical specimens of hospitalized patients in Turkey

GÜNDOĞDU A., ULU KILIÇ A., KILIÇ H.

26th European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, 9 - 12 Nisan 2016

2016

61. Bir üniversite hastanesinde çalışan yemekhane personelinde nazal Staphylococcus aureus taşıyıcılığı ve izolatların antibiyotik duyarlılıkları

DİNÇ G., KARACAGİL K., KILIÇ H., GÜNDOĞDU A., ALP E.

12. Antimikrobik Kemoterapi Günleri, Türkiye, 1 - 03 Nisan 2016, ss.186

2016

62. ATIK SU ARITMA SİSTEMLERİNİN GSBL-ÜRETEN E. COLI ÜZERİNE SEÇİCİ BASKISI; HALK SAĞLIĞI TEHLİKESİ?

GÜNDOĞDU A., KILIÇ H., ALP MEŞE E.

12. Antimikrobik Kemoterapi Günleri, İstanbul, Türkiye, 1 - 03 Nisan 2016, ss.141, (Tam Metin Bildiri)

2016

63. Yatan hastalardan izole edilen üropatojenik E coli izolatlarının virülens gen varlığı ve biyofilm formasyonu bakımından değerlendirilmesi

GÜNDOĞDU A., KATOULİ M., DİNÇ G., PARNİAN F., KILIÇ H.

12. Antimikrobik Kemoterapi Günleri, İstanbul, Türkiye, 1 - 03 Nisan 2016, ss.239

2016

64. Klinik S. maltophilia İzolatlarında sul ve intI Genlerinin Dağılımının Araştırılması ve PFGE Yöntemi ile Klonal Yakınlıklarının İncelenmesi

PARKAN Ö. M., KILIÇ H., GÜNDOĞDU A., ALP MEŞE E., TİMUR D., BERK E., et al.

12. Antimikrobik Kemoterapi Günleri, İstanbul, Türkiye, 1 - 03 Nisan 2016, ss.162, (Tam Metin Bildiri)

2016

65. Kayseri Bölgesinde Soyutlanan Salmonella Serovarlarının Dağılımı ve Antimikrobiyal Duyarlılıkları

GÜNDOĞDU A., KILIÇ H., ULU KILIÇ A., PARKAN Ö. M., TÜRE YÜCE Z.

12. Antimikrobik Kemoterapi Günleri, İstanbul, Türkiye, 1 - 03 Nisan 2016, ss.224-225, (Tam Metin Bildiri)

2016

66. GÜRCİSTAN'DA KLİNİKTE KULLANILAN BAKTERİYOFAJ KOKTEYLLERİNİN GSBL ÜRETEN E.COLI PATOJENLERİNE KARŞI İN VİTRO AKTİVİTELERİNİN ARAŞTIRILMASI

GÜNDOĞDU A., KILIÇ H., Bolkvadze D.

12. Antimikrobik Kemoterapi Günleri, İstanbul, Türkiye, 1 - 03 Nisan 2016, ss.232, (Tam Metin Bildiri)

2015

67. Bacterial contamination rate of PRF in standart room air 2nd International congress on stem cell and cellular therapies

DİNÇ G., KILIÇ H., GÜNDOĞDU A., KASIM K., ALP MEŞE E.

7TH EURASIAN CONGRESS, 30 Eylül - 03 Ekim 2015, (Tam Metin Bildiri)

2015

68. Virrulance Factors and Biofilm Formation of Uropathogenic E coli Isolated from Hospitalized Children and Adults

GÜNDOĞDU A., MOHAMMAD K., KILIÇ H., DİNÇ G., FATEMEH P.

The 7th EURASIA CONGRESS OF INFECTIOUS DISEASES, 30 Eylül - 03 Ekim 2015, (Tam Metin Bildiri)

2015

69. Epidemiology of nosocomial Infections in Turkish Pediatric Patients: A 1-Year Retrospective Study

GÜNDOĞDU A., KILIÇ H., ULU KILIÇ A., Aydin G., ALP MEŞE E.

The 7th EURASIA CONGRESS OF INFECTIOUS DISEASES, Tiflis, Gürcistan, 30 Eylül - 03 Ekim 2015, ss.161, (Tam Metin Bildiri)

2015

70. Evaluation of Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae Prevalence and Their Carbapanem Resistance Rates in Blood Cultures of a Cohort of Turkish Patients

DİNÇ G., KILIÇ H., GÜNDOĞDU A., Karacagil K., ALP MEŞE E.

The 7th EURASIA CONGRESS OF INFECTIOUS DISEASES, Tiflis, Gürcistan, 30 Eylül - 03 Ekim 2015, ss.121, (Tam Metin Bildiri)

2015

71. Ası Irmağı İle Belediye Atık/Arıtılmış Su Örneklerinde Enterobacterıacea’ların Varlığı ve Antibiyotik Duyarlılıklarının Belirlenmesi

KÜREKCİ C., YİPEL M., GÜNDOĞDU A.

Hatay’ın Çevre Sorunları ve Çözüm Önerileri Sempozyumu, Türkiye, 28 - 30 Mayıs 2015, (Özet Bildiri)

2015

72. Pediatrik Kan Dolaşımı Enfeksiyonları: Epidemiyoloji ve Antibiyotik Duyarlılıkları

GÜNDOĞDU A., KILIÇ H., ALP MEŞE E., PARKAN Ö. M., ULU KILIÇ A.

10. ANKEM Kongresi, Girne, Kıbrıs (Kktc), 6 - 10 Mayıs 2015, ss.150, (Tam Metin Bildiri)

2017

73. ÇOCUK VE YETISKIN HASTALARIN KAN KÜLTÜRLERINDEN IZOLE EDILEN DIRENÇLI

Şen İ., GÜNDOĞDU A., KILIÇ H.

4. Ulusal Klinik Mikrobiyoloji Kongresi, Antalya, Türkiye, 08 Kasım 2017 - 12 Kasım 1017, (Özet Bildiri)

Kitaplar

2022

1. Metagenomik Analizler

Gündoğdu A.

Moleküler Mikrobiyoloji Tanı ve Epidemiyoloji, Barış OTLU,Özgen ESER,Rıza DURMAZ, Editör, Akademisyen Yayınevi Kitabevi, Ankara, ss.215-235, 2022

2021

2. Jenerik probiyotik terapinin çıkmazı ve kişiselleştirilmiş probiyotik ihtiyacı

Gündoğdu A.

TIP VE MÜHENDİSLİK BAKIŞ AÇISIYLA PROBİYOTİKLER VE PREBİYOTİKLER, Prof. Dr. Zeynep Dilek HEPERKAN / Prof. Dr. Zeynep Çiğdem KAYACAN, Editör, İstanbul Aydın Üniversitesi Yayınları, İstanbul, ss.107-118, 2021

2020

3. Mikrobiyom Verisinin Biyoinformatik Analizi

Gündoğdu A., Nalbantoğlu Ö. U.

Mikrobiyota, Probiyotikler ve Akılcı Beslenme, Prof Dr Mustafa Altındiş, Editör, Nobel Yayın Dağıtım, Ankara, ss.93-109, 2020

2020

4. SARS-CoV-2 İçin Tüm Genom Dizileme ve Filogenetik Analiz

GÜNDOĞDU A.

Mikrobiyoloji ve COVID-19, , Editör, Türkiye Klinikleri Yayınevi, ss.50-56, 2020

Desteklenen Projeler

2016 - Devam Ediyor

Alzheimer Hastalığı ile İntestinal Mikrobiyomun Potansiyel İlişkisinin Metagenomik Analizlerle Değerlendirilmesi

TÜBİTAK Projesi , 1001 - Bilimsel ve Teknolojik Araştırma Projelerini Destekleme Programı

KÖSEOĞLU E. (Yürütücü), GÜNDOĞDU A., NALBANTOĞLU Ö. U.

2024 - 2026

Deprem afeti sonrası Kahramanmaraş’ta içme sularında görülen artan bulanıklık seviyesinin sulardaki bakteriyel yükle ilişkisinin ve suyu kullanan halk üzerindeki etkisinin incelenmesi

TÜBİTAK Projesi , 1001 - Bilimsel ve Teknolojik Araştırma Projelerini Destekleme Programı

(Proje Özeti)

Mutlu Sarıgüzel F. (Yürütücü), Nalbantoğlu Ö. U., Gün İ., Orak F., Gündoğdu A., Borlu A.

2023 - 2026

Akciğer Kanserinin Girişimsel Olmayan Tanısına Yönelik Oral Mikrobiyoma Dayalı Yapay Zeka Temelli Bir Tanı Yöntemi Geliştirilmesi

TÜBİTAK Projesi , 1001 - Bilimsel ve Teknolojik Araştırma Projelerini Destekleme Programı

Gündoğdu A. (Yürütücü), Nalbantoğlu Ö. U., Önal Ö., Baran Ketencioğlu B., Oral A.

2023 - 2025

Çoklu ilaca dirençli gram negatiflerin etken olduğu üriner sistem enfeksiyonlarında bakteriyofaj tedavisinin etkinliğinin araştırılması

TÜSEB B Grubu AR-GE Projesi

Gündoğdu A., Ulu Kılıç A. (Yürütücü), Nalbantoğlu Ö. U., Demirtaş A., Sezer Z., Ölmez H.

2023 - 2024

Deniz Ekosisteminde Metagenomik Analizler Ve Biyobelirteç Tabanlı İzleme Ile Musilaj Oluşum Potansiyelinin Araştırılması

TÜBİTAK Projesi , 1002 - Hızlı Destek Programı

Gündoğdu A., Aslan H., Karış G.(Yürütücü)

2023 - 2023

İnsan Kaynaklı Probiyotik Adaylarının İzolasyonu Ve Tüm Genom Analizleriyle Karakterizasyonu

TÜBİTAK Projesi , 1002 - Hızlı Destek Programı

Gündoğdu A., Nalbantoğlu Ö. U. (Yürütücü)

2021 - 2023

Fare Modelinde T-Reg Kaynaklı Eksozomların Multiple Skleroz Ve Psoriazisde Önleyici Ve Tedavi Edici Etkilerinin Araştırılması

TÜBİTAK Uluslararası Çoklu İşbirliği Projesi , ERA.NET Projesi

(Proje Özeti)

NALBANTOĞLU Ö. U., AKALIN H., GÖNEN Z. B., YAY A. H., DOĞAN M. E., BORLU M., et al.

2019 - 2023

Yakın alan elektroeğirme NFES tekniğiyle iyonik polimerbornitrürMFe2O4LiPr3 kompozit liflerinin hazırlanması ve kirli suların kimyasal ve biyolojik arıtımında kullanımı

Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Araştırma Projesi

SAÇMACI Ş. (Yürütücü), GÜNDOĞDU A., DEMİRDÖĞEN R. E., OCAKOĞLU K., EMEN F. M., SAÇMACI M., et al.

2016 - 2023

Hastane ve kentsel atık/arıtılmış su metagenomunda de nova mikrobiyal çeşitlilik rezistom virülom ve mobilom analizlerinin yapılması

Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Araştırma Projesi

GÜNDOĞDU A. (Yürütücü), KÜREKÇİ C., KILIÇ H., NALBANTOĞLU Ö. U.

2021 - 2022

Marmara Denizi Musilaj Mikrobiyomunun Shotgun Metagenom Dizileme ile Ortaya Çıkarılması ve Mikrobiyom Ağında Anahtar Unsur Olabilecek Potansiyel Mikroorganizmaların Araştırılması

TÜBİTAK Projesi , 1001 - Bilimsel ve Teknolojik Araştırma Projelerini Destekleme Programı

(Proje Özeti)

GÜNDOĞDU A. (Yürütücü), ONUK A. E., ASLAN H., NALBANTOĞLU Ö. U.

2020 - 2021

Pirol Karbazol Temelli Yeni 1,3,4-Oksadiazol Türevlerinin Sentezi ve Anti-Bakteriyel Aktivitelerinin İncelenmesi

TÜBİTAK Projesi , 1002 - Hızlı Destek Programı

Gündoğdu A., Şengül İ. F., Sağlam M. F.(Yürütücü)

2019 - 2021

Üç Boyutlu Biyo-Yazıcı Teknolojisi ile Fonksiyonel Canlı Biyomürekkep ve Kişiye Özgü Yara Örtüsü Üretimi

TÜBİTAK Projesi , 1003 - Öncelikli Alanlar Ar-Ge Projeleri Destekleme Programı

Gündoğdu A., Ölmez H., Yıldızhan Y., Çetin Y., Büke A. Ç., Kahveci M. Ü.

2017 - 2021

Klinik Numunelerden İzole Edilen Karbapenem Dirençli Klebsiella pneumoniae Kökenlerinin Rektal Sürüntü Kökenleri ile Karşılaştırılması

Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Y.Lisans

KILIÇ H. (Yürütücü), GÜNDOĞDU A., AKMAN N.

2019 - 2020

Allojenik kemik iliği nakli sonrası gelişen bağırsak Graft Versus Host Hastalığında fekal transplantasyonun etkinliği

Diğer Özel Kurumlarca Desteklenen Proje

Can Sezgin G. (Yürütücü), Gürsoy Ş., Kaynar L., Gündoğdu A.

2017 - 2019

Ortopedik Protez Enfeksiyon Mikrobiyotasının Metagenomik Yöntemlerle De Novo Incelenmesi

TÜBİTAK Projesi , 1001 - Bilimsel ve Teknolojik Araştırma Projelerini Destekleme Programı

GÜNDOĞDU A. (Yürütücü)

2017 - 2019

Kolistin Dirençli Gram-Negatif Patojenlerde Direnç Kazanım Paternlerinin Tüm Genom Dizi Analizleriyle Ortaya Çıkarılması

TÜBİTAK Projesi , 3001 - Başlangıç Ar-Ge Projeleri Destekleme Programı

ULU KILIÇ A. (Yürütücü), GÜNDOĞDU A., KILIÇ H., ALP MEŞE E., NALBANTOĞLU Ö. U.

2016 - 2019

Yoğunbakım Ünitelerinde Mikrobiyom Bulaş Ağının Çıkarımı İçin Hesaplamalı Kaynak İzsürümü Yöntemlerinin Araştırılması Ve Geliştirilmesi

TÜBİTAK Projesi , 3501 - Ulusal Genç Araştırmacı Kariyer Geliştirme Programı

NALBANTOĞLU Ö. U. (Yürütücü), GÜNDOĞDU A., ALP MEŞE E., ULU KILIÇ A., COŞKUN R.(Yürütücü), ÖZTÜRK C.

2016 - 2017

Nanogözenek DNA Dizilemesi Ile Hızlı Patojen Tanıma Yapabilen Algoritmaların Geliştirilmesi

TÜBİTAK Projesi , 1002 - Hızlı Destek Programı

NALBANTOĞLU Ö. U. (Yürütücü), GÜNDOĞDU A.

2014 - 2015

Hastane atık sularının karıştığı şehir kanalizasyon sisteminin arıtma öncesinde ve sonrasında GSBL üreten E. coli ve pandemik O25-ST131 klonu bakımından taranması

TÜBİTAK Projesi

GÜNDOĞDU A. (Yürütücü), KILIÇ H., ALP MEŞE E.

Patent

2024

Microorganisms converting inositol to butyrate

Patent

Başvuru Yapıldı, Buluşun Başvuru Numarası: EP/22185855.8 , Standart Tescil

2023

BAĞIRSAK MİKROBİYOMUNDAN ALZHEİMER HASTALIĞININ TEŞHİSİ İÇİN MİNİMAL BİYOBELİRTEÇLER VE İLGİLİ YENİ NESİL DİZİLEME KİTİ

Patent

Tescil Edildi, Buluşun Tescil No: 2018 18373 , Standart Tescil

2022

BİR MİKROBİYAL GEN TANIMLAMA YÖNTEMİ, BU YÖNTEMİN KULLANILDIĞI TANIMLAMA KİTİ VE SİROZA İLİŞKİN BİYOBELİRTEÇLER

Patent

Tescil Edildi, Buluşun Tescil No: 2017 21166 , Standart Tescil

Bilimsel Kuruluşlardaki Üyelikler / Görevler

2021 - Devam Ediyor

TÜRK MİKROBİYOLOJİ CEMİYETİ

Yönetim Kurulu Üyesi

2020 - Devam Ediyor

SAĞLIK BİLİMLERİ ARAŞTIRMA GRUBU

Yürütme Kurulu Üyesi

2018 - 2020

SAĞLIK BİLİMLERİ ARAŞTIRMA GRUBU

Danışma Kurulu Üyesi

Kongre ve Sempozyum Katılımı Faaliyetleri

01 Şubat 2019 - 01 Şubat 2019

7. Pediatrik Probiyotik Prebiyotik Akademisi

Davetli Konuşmacı

Antalya-Türkiye

01 Aralık 2018 - 01 Aralık 2018

Probiyotiklerin Mühendislik ve Klinik Uygulamaları

Davetli Konuşmacı

İstanbul-Türkiye

01 Kasım 2018 - 01 Kasım 2018

Febril Nötropeni Mezuniyet Sonrası Eğitim Kursu

Davetli Konuşmacı

Ankara-Türkiye

01 Kasım 2018 - 01 Kasım 2018

XXXVIII TMC Kongresi

Davetli Konuşmacı

Antalya-Türkiye

01 Nisan 2018 - 01 Nisan 2018

13. Antimikrobik Kemoterapi Günleri

Davetli Konuşmacı

İstanbul-Türkiye

01 Nisan 2018 - 01 Nisan 2018

2nd International Human Microbiota: In health and diseases congress

Davetli Konuşmacı

Antalya-Türkiye

01 Nisan 2018 - 01 Nisan 2018

2nd International Human Microbiota: In health and diseases congress

Davetli Konuşmacı

Antalya-Türkiye

01 Mart 2018 - 01 Mart 2018

XIX. Türk Klinik Mikrobiyoloji ve İnfeksiyon Hastalıkları Kongresi

Davetli Konuşmacı

Antalya-Türkiye

01 Eylül 2017 - 01 Eylül 2017

International Conference and Expo on Clinical Virology and Infectious Diseases

Davetli Konuşmacı

Texas-Amerika Birleşik Devletleri

01 Nisan 2017 - 01 Nisan 2017

TÜBA-Mikrobiyota ve İnsan Sağlığı Sempozyumu

Davetli Konuşmacı

Ankara-Türkiye

01 Aralık 2016 - 01 Aralık 2016