Doç.Dr.

AYCAN GÜNDOĞDU


Tıp Fakültesi

Temel Tıp Bilimleri

Tıbbi Mikrobiyoloji

Eğitim Bilgileri

2008 - 2013

2008 - 2013

Doktora

Australian National University, Faculty Of Health And Science, Avustralya

Araştırma Alanları

Sağlık Bilimleri, Tıp, Temel Tıp Bilimleri, Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji, Tıbbi Mikrobiyoloji, Temel Bilimler, Yaşam Bilimleri, Mikrobiyoloji, Bakteriyoloji

Akademik Unvanlar / Görevler

2018 - Devam Ediyor

2018 - Devam Ediyor

Dr.Öğr.Üyesi

Erciyes Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Temel Bilimler

2014 - 2018

2014 - 2018

Yrd.Doç.Dr.

Erciyes Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Temel Bilimler

SCI, SSCI ve AHCI İndekslerine Giren Dergilerde Yayınlanan Makaleler

2020

2020

COVID-19 Pandemic: Group Testing

Nalbantoğlu Ö. U. , Gündoğdu A.

FRONTIERS IN MEDICINE, cilt.7, 2020 (SCI İndekslerine Giren Dergi) identifier identifier identifier

2019

2019

Presence of OXA-48 Gene in a Clinical Isolate of Lactobacillus rhamnosus

HAZIROLAN G., GÜNDOĞDU A. , Nigiz S., ALTUN B., GÜR D.

FOODBORNE PATHOGENS AND DISEASE, 2019 (SCI İndekslerine Giren Dergi) identifier identifier

2018

2018

The first report of mobile colistin resistance gene (mcr-1) carrying Escherichia coli in Turkey

KUREKCI C., AYDIN M., NALBANTOĞLU Ö. U. , GÜNDOĞDU A.

JOURNAL OF GLOBAL ANTIMICROBIAL RESISTANCE, cilt.16, 2018 (SCI Expanded İndekslerine Giren Dergi)

2017

2017

Could Frequent Carbapenem Use Be a Risk Factor for Colistin Resistance?

GÜNDOĞDU A. , Ulu-Kilic A. , KILIÇ H. , OZHAN E., ALTUN D., CAKIR O., et al.

MICROBIAL DRUG RESISTANCE, cilt.24, ss.774-781, 2017 (SCI İndekslerine Giren Dergi) identifier identifier identifier

2016

2016

Characterisation of Phenotypic and Genotypic Antibiotic Resistance Profile of Enterococci from Cheeses in Turkey

Kurekci C., Onen S. P. , Yipel M., Aslantas O., GÜNDOĞDU A.

KOREAN JOURNAL FOR FOOD SCIENCE OF ANIMAL RESOURCES, cilt.36, ss.352-358, 2016 (SCI İndekslerine Giren Dergi) Creative Commons License identifier identifier identifier

2012

2012

Prevalence and pathogenesis of extended-spectrum beta-lactamase producing Escherichia coli causing urinary tract infection in hospitalized patients

Guendogdu A. , LONG Y. B. , KATOULI M.

EUROPEAN JOURNAL OF CLINICAL MICROBIOLOGY & INFECTIOUS DISEASES, cilt.31, ss.3107-3116, 2012 (SCI İndekslerine Giren Dergi) identifier identifier identifier

Diğer Dergilerde Yayınlanan Makaleler

2019

2019

Rapid detection of difficult-to-culture bacterial pathogens using real-time nanopore sequencing

GÜNDOĞDU A. , ULU KILIÇ A. , KILIÇ H. , NALBANTOĞLU Ö. U.

Infectious Diseases and Clinical Microbiology, cilt.1, ss.128-133, 2019 (Diğer Kurumların Hakemli Dergileri) Creative Commons License

2019

2019

Mikrobiyom Modülasyonunda Kişiselleştirilmiş Probiyotik İhtiyacı

Gündoğdu A.

Tıp Fakültesi Klinikleri Dergisi, cilt.2, ss.79-82, 2019 (Hakemli Üniversite Dergisi) Creative Commons License

2018

2018

Bacteriophage Therapy: An Unforgetten Source of Cure

GÜNDOĞDU A. , ULU KILIÇ A.

KLIMIK JOURNAL, cilt.31, ss.78-87, 2018 (ESCI İndekslerine Giren Dergi) Creative Commons License identifier identifier

2016

2016

Bir Süper Organizma Olarak İnsan; Mikrobiyomun Genetik Kontrolü

GÜNDOĞDU A.

TÜRK MİKROBİYOLOJİ CEMİYETİ DERGİSİ, cilt.46, ss.147-151, 2016 (Diğer Kurumların Hakemli Dergileri)

2015

2015

Antibiyotik Çağı Sonunda Keşfedilen Yeni Dünyalar: Rezistom ve Mobilom

GÜNDOĞDU A. , ALP MEŞE E.

Flora İnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Dergisi, cilt.20, ss.167-173, 2015 (Diğer Kurumların Hakemli Dergileri)

Hakemli Kongre / Sempozyum Bildiri Kitaplarında Yer Alan Yayınlar

2019

2019

Mikrobiyom Çalışmalarında Laboratuvar Süreçleri ve Translasyonel Yaklaşımlar

GÜNDOĞDU A.

7. Pediatrik Probiyotik Prebiyotik Akademisi, Antalya, Türkiye, 21 - 24 Şubat 2019, ss.25-27

2018

2018

The taxonomic origins of the antimicrobial resistance genes present in hot-spot environments.

HORA M., GÜNDOĞDU A. , KILIÇ H.

38. Türk mikrobiyoloji cemiyeti kongresi, Antalya, Türkiye, 4 - 08 Kasım 2018, ss.21

2018

2018

Antimicrobial resistance, genomic and molecular epidemiologic analysis of Salmonella serovars in Hacettepe University Hospitals

Ünalan T., Demirci S., Eser Ö., GÜNDOĞDU A. , Çakar A., Güleşen R., et al.

ESCMID/ASM Conference on Drug Development to Meet the Challenge of Antimicrobial Resistance, Lizbon, Portekiz, 4 - 07 Eylül 2018, ss.34

2018

2018

Poten1al an1microbials figh1ng XDR-pathogens; A study on the isola1on and characteriza1on of lytic bacteriophages effec1ve on colis1n resistance K. pneumoniae

GÜNDOĞDU A. , ULU KILIÇ A. , Arslan B., KILIÇ H.

ESCMID/ASM Conference on Drug Development to Meet the Challenge of Antimicrobial Resistance, Lizbon, Portekiz, 4 - 07 Eylül 2018, ss.35

2018

2018

Comparison of Gut Microbiota in Patients of Mild-Cognitive Impairment and Alzheimer’s Diseasewith Age and Sex Matched Normal Controls: A Multicenter Study.

NALBANTOĞLU Ö. U. , Sezgin B., GÜNDOĞDU A. , Koç F., GÖL M. F. , Hanoğlu L., et al.

The 7th annual International Human Microbiome Consortium Meeting (IHMC2018), Killarney, İrlanda, 26 - 28 Haziran 2018, ss.165

2018

2018

Potential microbial biomarkers of lung cancer

GÜNDOĞDU A. , ÖNAL Ö. , DEMİR Ö. F. , ÖNAL M. G. , NALBANTOĞLU Ö. U.

28th European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, 21 - 24 Nisan 2018

2018

2018

Biomarkers of Diseases in Human Microbiome-Practice

GÜNDOĞDU A.

The 2nd International Congress on Human Microbiota and Health Effects, Antalya, Türkiye, 18 - 22 Nisan 2018, ss.37

2018

2018

Accurate Classification and Biomarker Discovery in Disease Microbiome Using a Novel De Novo Bioinformatics Approach

NALBANTOĞLU Ö. U. , Yalçın K., GÜNDOĞDU A.

2nd International Human Microbiota: In health and diseases congress, Antalya, Türkiye, 18 - 22 Nisan 2018, ss.63

2018

2018

Should Bacterial Etiologies Be Considered in Aseptic Loosening?

GÜNDOĞDU A. , NALBANTOĞLU Ö. U. , ULU KILIÇ A. , KAFADAR I. H. , GÜNEY A. , KILIÇ H.

2nd International Human Microbiota: In health and diseases congress, Antalya, Türkiye, 18 - 22 Nisan 2018, ss.71

2018

2018

Towards Microbiome-Based Liquid Biopsy: Oral Microbiota Harbors Highly Accurate Biomarkers of Lung Cancer

GÜNDOĞDU A. , NALBANTOĞLU Ö. U. , ÖNAL Ö. , Önal M. G.

2nd International Human Microbiota: In health and diseases congress, Antalya, Türkiye, 18 - 22 Nisan 2018, ss.60-61

2018

2018

sHOULD Bacterial Etiologies be cONSİDERED İN Aseptic loonening?

Gündoğdu A. , Kılıç H.

2nd. HUMAN Microbiata: In health and diseases Cong., ANTALYA,TÜRKİYE,, Antalya, Türkiye, 18 - 22 Nisan 2018, ss.71

2018

2018

Resistome

GÜNDOĞDU A.

2nd International Human Microbiota: In health and diseases congress, Antalya, Türkiye, 12 - 22 Nisan 2018, ss.2

2018

2018

General Compositional Trends in Human Gut Microbiome: Diverse Phylogenetic Profiles Converge in Function According to Latent Structure Analysis

Elgun U. G. , GÜNDOĞDU A. , NALBANTOĞLU Ö. U.

2nd International Human Microbiota: In health and diseases congress, Antalya, Türkiye, 18 - 22 Nisan 2018, ss.62

2018

2018

Microbiome Network Analysis Reveals Highly Symbiotic Interaction of Core Metabolic Pathways

Taylan B., GÜNDOĞDU A. , NALBANTOĞLU Ö. U.

2nd International Human Microbiota: In health and diseases congress, Antalya, Türkiye, 18 - 22 Nisan 2018, ss.95

2018

2018

Persistence of Microbial Communities in the Hospital Environment

Aslan-Gürpınar E., NALBANTOĞLU Ö. U. , KILIÇ H. , ULU KILIÇ A. , GÜNDOĞAN K. , GÜNDOĞDU A.

2nd International Human Microbiota: In health and diseases congress, Antalya, Türkiye, 18 - 22 Nisan 2018, ss.44

2018

2018

Turkish Microbes: Previously Non-Catalogued Genes Were Detected in the Gut Metagenomes of Turkish Individuals

Hora M., Yalçın K., GÜNDOĞDU A.

2nd International Human Microbiota: In health and diseases congress, Antalya, Türkiye, 18 - 22 Nisan 2018, ss.59

2018

2018

Whole-genome sequencing reveals recently acquired virulence islands in Ralstonia mannitolilytica isolated from high-risk patients

NALBANTOĞLU Ö. U. , KILIÇ H. , ULU KILIÇ A. , Hora M., GÜNDOĞDU A.

28th European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases8th European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, Madrid, İspanya, 21 Nisan 2018, ss.1765

2018

2018

Comparison of antimicrobial resistance-gene diversity in gut microbiome of healthy individuals from Turkey, Europe, America and China

GÜNDOĞDU A. , Yalçın K., ULU KILIÇ A. , Saka S., NALBANTOĞLU Ö. U.

28th European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases8th European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, Madrid, İspanya, 21 Nisan 2018, ss.1512

2018

2018

İnsan ve Çevre Mikrobiyomunda Rezistom-Mobilom Döngüleri

GÜNDOĞDU A.

13. Antimikrobik Kemoterapi Günleri, İstanbul, Türkiye, 6 - 08 Nisan 2018, ss.20

2018

2018

Klinik Metagenomiğin Vaadleri ve Problemleri

GÜNDOĞDU A.

XIX. Türk Klinik Mikrobiyoloji ve İnfeksiyon Hastalıkları Kongresi, Antalya, Türkiye, 28 - 31 Mart 2018, ss.1

2018

2018

Oral mikrobiyomdan potansiyel karaciğer kanseri biyobelirteçlerinin Keşfi

Yalçın K., GÜNDOĞDU A. , NALBANTOĞLU Ö. U.

3. Yaşam Bilimleri Kongresi, Kayseri, Türkiye, 24 - 25 Şubat 2018, ss.1

2017

2017

KOLISTIN DIRENÇLI K. PNEUMONIAE’YA ETKILI LITIK BAKTERIYOFAJLARIN IZOLASYONU VE KARAKTERIZASYONU

GÜNDOĞDU A. , ULU KILIÇ A. , KILIÇ H. , Arslan B.

4. Ulusal Klinik Mikrobiyoloji Kongresi, Antalya, Türkiye, 8 - 12 Kasım 2017, ss.416

2017

2017

METAGENOMIK ANALIZLER ÜZERIDEN SAGLIKLI INSAN BAGIRSAGINDAKI REZISTOM ÇESITLILIGININ ORTAYA ÇIKARILMASI

GÜNDOĞDU A. , NALBANTOĞLU Ö. U. , Yalçın K.

4. Ulusal Klinik Mikrobiyoloji Kongresi, Antalya, Türkiye, 8 - 12 Kasım 2017, ss.208-209

2017

2017

Phage therapy: An alternative treatment option for bacterial infections caused by extensively-drug resistant pathogens

GÜNDOĞDU A.

International Conference and Expo on Clinical Virology and Infectious Diseases, Houston, Amerika Birleşik Devletleri, 18 - 19 Eylül 2017, ss.3

2017

2017

A NEW COLISTIN RESISTANCE GENE HOMOLOGOUS FOUND IN WASTEWATER METAGENOME

GÜNDOĞDU A. , Önal M. G. , ULU KILIÇ A. , NALBANTOĞLU Ö. U.

The 7th Congress of European Microbiologists (FEMS 2017), Valensiya, İspanya, 9 - 13 Temmuz 2017, ss.1998

2017

2017

An alternative vancomycin resistant enterococci decolonization strategy: bacteriophage therapy

ULU KILIÇ A. , GÜNDOĞDU A. , KILIÇ H. , ALP MEŞE E.

27th European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases7th European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, 22 - 25 Nisan 2017

2017

2017

Molecular characterization of clinical Stenotrophomonas maltophilia isolates from a tertiary care hospital in Kayseri, Turkey

PARKAN Ö. M. , KILIÇ H. , GÜNDOĞDU A. , ALP MEŞE E. , TİMUR D. , Ünaldı Ö., et al.

27th European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases (ECCMID), Viyana, Avusturya, 22 - 25 Nisan 2017, ss.2910

2017

2017

Rapid pathogen detection in ambiguous infections using real-time nanopore sequencing technology

GÜNDOĞDU A. , KILIÇ H. , ULU KILIÇ A. , NALBANTOĞLU Ö. U.

27th European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, 22 - 25 Nisan 2017

2017

2017

A high resistome diversity in a metropolitan hospital wastewater in Turkey revealed using shotgun metagenomics

GÜNDOĞDU A. , NALBANTOĞLU Ö. U. , KILIÇ H.

27th European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, 22 - 25 Nisan 2017

2017

2017

Bir Süper Organizma Olarak İnsan: Mikrobiyom ve Metagenom

GÜNDOĞDU A.

TÜBA-Mikrobiyota ve İnsan Sağlığı Sempozyumu, Ankara, Türkiye, 10 Nisan 2017, ss.1

2016

2016

Strain level pathogen detection in metagenomic samples using posterior profile corrections

NALBANTOĞLU Ö. U. , GÜNDOĞDU A.

The 6th annual International Human Microbiome Consortium Congress, Houston, Amerika Birleşik Devletleri, 8 - 11 Kasım 2016, ss.41

2016

2016

Plasmids with a potential of pandrug resistance coding found in human gut microbiome

GÜNDOĞDU A. , NALBANTOĞLU Ö. U.

The 6th annual International Human Microbiome Consortium Congress, Houston, Amerika Birleşik Devletleri, 8 - 11 Kasım 2016, ss.36

2016

2016

Susceptibility of ESBL-producing Escherichia coli to commercial bacteriophage coctails originated in Georgia

GÜNDOĞDU A. , KILIÇ H. , Bolkvadze D.

26th European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, Amsterdam, Hollanda, 9 - 12 Nisan 2016, ss.153

2016

2016

Sewage treatment plants cause artifical selection of ESBL-producing E. coli threatening public health

GÜNDOĞDU A. , KILIÇ H. , ALP MEŞE E.

26th European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, Amsterdam, Hollanda, 9 - 12 Nisan 2016, ss.45

2016

2016

Clonal diversity and virulence characteristics of UPEC strains with their adhesion capability on Caco-2 and A-498 cell lines

GÜNDOĞDU A. , KILIÇ H. , Astley D., KATOULI M.

26th European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, Amsterdam, Hollanda, 9 - 12 Nisan 2016, ss.192

2016

2016

Human as a source of colistin resistance: presence of the mcr-1 gene in the gut microbiome

GÜNDOĞDU A. , NALBANTOĞLU Ö. U.

26th European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, Amsterdam, Hollanda, 9 - 12 Nisan 2016

2016

2016

ATIK SU ARITMA SİSTEMLERİNİN GSBL-ÜRETEN E. COLI ÜZERİNE SEÇİCİ BASKISI; HALK SAĞLIĞI TEHLİKESİ?

GÜNDOĞDU A. , KILIÇ H. , ALP MEŞE E.

12. Antimikrobik Kemoterapi Günleri, İstanbul, Türkiye, 1 - 03 Nisan 2016, ss.141

2015

2015

Epidemiology of nosocomial Infections in Turkish Pediatric Patients: A 1-Year Retrospective Study

GÜNDOĞDU A. , KILIÇ H. , ULU KILIÇ A. , Aydin G., ALP MEŞE E.

The 7th EURASIA CONGRESS OF INFECTIOUS DISEASES, Tiflis, Gürcistan, 30 Eylül - 03 Ekim 2015, ss.161

2017

2017

ÇOCUK VE YETISKIN HASTALARIN KAN KÜLTÜRLERINDEN IZOLE EDILEN DIRENÇLI

Şen İ., GÜNDOĞDU A. , KILIÇ H.

4. Ulusal Klinik Mikrobiyoloji Kongresi, Antalya, Türkiye, 08 Kasım 2017 - 12 Kasım 1017

Desteklenen Projeler

Ödüller

Nisan 2019

Nisan 2019

poster bildri BİRİNCİLİK ÖDÜLÜ

7. Türkiye Ekmud Bilimsel Platformu "Uluslarası Kongre"

Mayıs 2016

Mayıs 2016

Standart BAKTERİYOFAJ AKTİVİTELERİNİN ARAŞTIRILMASI SÖZLÜ SUNUM İKİNCİSİ

6.Türkiye Ekmud Kongresi

Mart 2016

Mart 2016

Atık Su ARITMA SİSTEMLERİNİN GENİŞLEMİŞ SPEKTRUMLU BETa-LAKTAMAz ÜRETEN e.coli üzerine seçici baskısı, halk sağlığı tehlikesi

Erciyes Üniv. Tıp Fak.

Mart 2016

Mart 2016

Komplike deri ve yumuşak doku enfeksiyonu etkeni çoklu dirençli patojenlerin bakteriyofaj duyarlılıklarının araştırılması

Erciyes Üniv. Tıp Fakültesi



Davetli Kongre ve Sempozyum Faaliyetleri

2019

2019

7. Pediatrik Probiyotik Prebiyotik Akademisi

Davetli Konuşmacı

Antalya-Türkiye

2018

2018

Probiyotiklerin Mühendislik ve Klinik Uygulamaları

Davetli Konuşmacı

İstanbul-Türkiye

2018

2018

XXXVIII TMC Kongresi

Davetli Konuşmacı

Antalya-Türkiye

2018

2018

Febril Nötropeni Mezuniyet Sonrası Eğitim Kursu

Davetli Konuşmacı

Ankara-Türkiye

2018

2018

2nd International Human Microbiota: In health and diseases congress

Davetli Konuşmacı

Antalya-Türkiye

2018

2018

2nd International Human Microbiota: In health and diseases congress

Davetli Konuşmacı

Antalya-Türkiye

2018

2018

13. Antimikrobik Kemoterapi Günleri

Davetli Konuşmacı

İstanbul-Türkiye

2018

2018

XIX. Türk Klinik Mikrobiyoloji ve İnfeksiyon Hastalıkları Kongresi

Davetli Konuşmacı

Antalya-Türkiye

2017

2017

International Conference and Expo on Clinical Virology and Infectious Diseases

Davetli Konuşmacı

Texas-Amerika Birleşik Devletleri

2017

2017

TÜBA-Mikrobiyota ve İnsan Sağlığı Sempozyumu

Davetli Konuşmacı

Ankara-Türkiye

2016

2016

Ulusal İnsan Mikrobiyotası ve Sağlığımıza Etkileri Kongresi

Davetli Konuşmacı

Ankara-Türkiye

Atıflar

Toplam Atıf Sayısı (WOS): 211

h-indeksi (WOS): 8