Hakkımızda

Metrikler

Yayın

14

Atıf (WoS)

11

Atıf (Scopus)

12

Proje

3
BM Sürdürülebilir Kalkınma Amaçları

Tam Adı: Computer-Aided Drug Design and Synthesis Research Group (Bilgisayar Destekli İlaç Tasarımı ve Sentez Araştırma Grubu)
Kuruluş Tarihi: 23.02.2025
Konum: ERÜ Eczacılık Fakültesi
Misyon: CADDS Research Group, protein tirozin kinazlarını (PTK) hedef alarak yenilikçi ilaç tasarımı ve sentezi geliştirmeyi amaçlayan disiplinler arası bir araştırma grubudur. Bilgisayar destekli yöntemler ve deneysel yaklaşımları birleştirerek, kanser gibi PTK disregülasyonunun önemli rol oynadığı hastalıklara yönelik etkili terapötik ajanlar geliştirmeyi hedefler.


Araştırma Odakları


CADDS Research Group, protein tirozin kinazlarının (PTK) biyolojik rollerine ve bu enzimlerin kanser, inflamatuar hastalıklar ve diğer patolojik durumlardaki disregülasyonuna odaklanır. PTK'lar, hücre sinyalizasyonunda kritik bir rol oynar ve tirozin kalıntılarının fosforilasyonu yoluyla hücre bölünmesi, büyüme ve apoptoz gibi süreçleri düzenler. Grubun ana araştırma alanları şunlardır:


  1. Hedef Belirleme ve Modelleme: PTK'ların üç boyutlu yapılarını incelemek için moleküler modelleme ve simülasyon tekniklerini kullanır. Özellikle reseptör tipi (örneğin, EGFR, VEGFR) ve reseptör dışı (örneğin, Src, JAK) PTK'ların aktif bölgeleri analiz edilir.

  2. İlaç Tasarımı: Bilgisayar destekli ilaç tasarımı (CADD) yöntemleriyle, PTK inhibitörleri olarak işlev görebilecek küçük moleküller tasarlanır. Bu süreçte, moleküler yerleştirme (docking), farmakofor modelleme ve yapı-aktivite ilişkisi (SAR) çalışmaları yürütülür.

  3. Sentez ve Test: Tasarlanan moleküllerin kimyasal sentezi gerçekleştirilir ve in vitro/in vivo deneylerle etkinlikleri test edilir. Özellikle lösemi, akciğer kanseri ve meme kanseri gibi PTK bağımlı kanser türleri üzerinde durulur.

  4. Direnç Mekanizmaları: PTK inhibitörlerine karşı gelişen ilaç direncini anlamak ve bu direnci aşacak yeni stratejiler geliştirmek.

Protein Tirozin Kinazlar Üzerindeki Çalışmalar


Protein tirozin kinazlar (PTK), insan genomunda 90 benzersiz genle temsil edilen büyük bir enzim ailesidir. Bu enzimler, 58 reseptör tipi ve 32 reseptör dışı olmak üzere iki ana gruba ayrılır. CADDS Research Group, özellikle şu PTK'ları hedef alır:


  • EGFR (Epidermal Growth Factor Receptor): Akciğer ve kolorektal kanserlerde sıkça mutasyona uğrayan bir reseptör PTK.

  • Src Kinazlar: Hücre proliferasyonu ve metastazda rol oynayan reseptör dışı kinazlar.

  • JAK (Janus Kinase): Lösemi gibi hematolojik malignitelerde önemli bir hedef.

  • ABL1 (BCR-ABL1 füzyonu): Kronik miyeloid lösemide (CML) anahtar bir rol oynar.

Grubun amacı, bu kinazların aktif bölgelerine özgü inhibitörler tasarlayarak, ATP rekabetçi veya allosterik inhibitörlerle kanser hücrelerinin kontrolsüz büyümesini engellemektir. Örneğin, EGFR için geliştirilen inhibitörler (gefitinib benzeri) veya BCR-ABL1 için imatinib gibi bilinen moleküllerden ilham alınarak yeni nesil ajanlar tasarlanır.


Yöntemler


  • In Silico Analiz: Moleküler dinamik simülasyonları ve kuantum kimyasal hesaplamalarla PTK-inhibitor etkileşimleri modellenir.

  • Kimyasal Sentez: Organik sentez teknikleriyle potansiyel inhibitörler üretilir.

  • Biyolojik Testler: Hücre dizilerinde (örneğin, A549, K562) ve hayvan modellerinde etkinlik ve toksisite testleri yapılır.

Ekip ve İşbirlikleri


CADDS Research Group, medisinal kimya alanında ihtisas yapmış ve yapıyor olan bir ekipten oluşur. Grup, ulusal ve uluslararası üniversiteler, ilaç firmaları ve araştırma enstitüleriyle iş birliği yapar.


Başarılar ve Hedefler


  • Yayınlar: Grup, PTK inhibitörleri üzerine yüksek etkili dergilerde makaleler yayımlamayı hedefler (örneğin, Journal of Medicinal Chemistry ve European Journal of Medicinal Chemistry).

  • Patentler: Yeni moleküller için patent başvuruları planlanır.

  • Klinik Çeviri: Tasarlanan inhibitörlerin klinik öncesi aşamalardan klinik çalışmalara geçişi amaçlanır.