Benzotiyenopirimidin bileşik serisinin elektron konformasyon-genetik algoritma (EC-GA) yöntemiyle 4D-QSAR incelenmesi


Tezin Türü: Yüksek Lisans

Tezin Yürütüldüğü Kurum: Erciyes Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, KİMYA ANABİLİM DALI, Türkiye

Tezin Onay Tarihi: 2019

Tezin Dili: Türkçe

Öğrenci: HARUN KESKİN

Danışman: Emin Sarıpınar

Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu

Özet:

Bu çalışmada grubumuz tarafından geliştirilen Elektron Konformasyonel Genetik Algoritma (EC-GA) metodu kullanılarak Pim-1 ve Pim-2 inhibisyonu gösteren 96 adet benzotiyenopirimidin türevi bileşiklerin biyolojik aktivitesinden sorumlu farmakofor grubu bulunmuş ve nicel aktivite tahmini yapılmıştır. Bileşiklerin kuantum kimyasal hesaplamaları HF 3-21 G* metodu kullanılarak (sulu ortamda) yapıldıktan sonra yük, mesafe, bağ derecesi, kartezyen koordinatları ve konformasyon analiz bilgilerinden faydalanılarak serideki bileşiklerin bütün konformerleri için Elektron Konformasyonel Uygunluk Matrisleri (ECMC) hazırlanmıştır. EMRE programı kullanılarak ECMC'ler belirli tolerans değerleri içerisinde karşılaştırılıp benzotiyenopirimidin bileşikleri için aktiviteden sorumlu farmakofor grubu bulunmuştur. Bu bileşikler için inhibisyon aktivitelerine etki eden parametre gruplarının belirlenmesi ve teorik aktivite değerlerinin bulunması için EMRE yazılımı içinde olan genetik algoritma metodu kullanılmıştır. Ayrıca bileşikler eğitim ve test seti olarak sınıflandırılarak seride modeller kullanılmıştır. Modellerin doğruluğu çapraz doğrulama ve istatistiksel olarak yapılmıştır. Benzotiyenopirimidin serisi Pim-1 inhibisyonu için q2, R2eğitim, R2test değerleri sırasıyla 0,9170; 0,9519; 0,8326 olarak hesaplanmıştır. Pim-2 inhibisyonu için ise q2, R2eğitim, R2test değerleri sırasıyla 0,8859; 0,9265; 0,9311 olarak hesaplanmıştır.