Akademik Veri Yönetim Sistemi
Tezin Türü: Yüksek Lisans
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Erciyes Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, KİMYA ANABİLİM DALI, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2008
Tezin Dili: Türkçe
Öğrenci: EBRU KAYA
Danışman: Emin Sarıpınar
Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu
Özet:Bu çalışmada 1-[(2-hidroksietoksi)metil]-6-(feniltiyo)timin (HEPT) bileşiklerinin Elektron Konformasyon-Genetik Algoritma (EC-GA) ile kantitatif HIV aktivite hesaplaması ve farmakofor (Pha) grubu tanımlaması yapılmıştır. Serideki bütün bileşikler için Elektron Konformasyonel Uygunluk Matrisleri (ECMC) bileşiklerin elektronik yapı hesaplamaları ve konformasyon analiz bilgilerinden faydalanılarak EMRE 1.2 programı ile hazırlanmıştır. ECMC ler Pha grubu temsil eden ve aktif bileşiklerin hepsinde aynı olan Elektron Konformasyonel Alt Matrisi (ECSA) bulmak için karşılaştırılır. Moleküler parametreler serideki bütün bileşiklerin her bir konformeri için çalışma grubumuz tarafından geliştirilen EMRE 1.2 programı ile hazırlandı ve bu parametreler aktiviteyi hesaplamak için Genetik Algoritma Optimizasyon Tekniğinde kullanıldı. Biyolojik aktivite hesaplaması için 174 parametre hazırlandı. Ancak bu moleküler parametrelerin hepsi aktivite hesaplaması için önemli değildir. Bu parametrelerin önemli olanlarını seçmek ve aktivitelerine karar vermek için genetik algoritma optimizasyon tekniği ve en küçük kareler yöntemi kullanılmıştır. 80 bileşik için deneysel ve hesaplanan aktivite arasındaki korelasyon katsayısı, R2, 0.9153 olarak bulunmuştur. Bu çalışmalara ek olarak bileşik serisi eğitim seti (45 bileşik) ve test seti (35 bileşik) olmak üzere iki gruba ayrılmıştır. Eğitim setinin biyoaktivitesini en iyi parametrelerle hesaplamak için, GA ve lsqnonlin metodları kullanılmıştır. Eğitim setinden elde edilen moleküler parametreler kullanılarak test seti için biyoaktivite belirlenmiştir. R değerleri eğitim ve test seti için sıra ile 0.9460 ve 0.7080 olarak hesaplanmıştır.Anahtar Kelimeler: QSAR,EC-GA, HEPT, HIV-1, Farmakofor