Akademik Veri Yönetim Sistemi
Tezin Türü: Yüksek Lisans
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Erciyes Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, -, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2015
Tezin Dili: Türkçe
Öğrenci: SERAP DEMİREL
Eş Danışman: Kahraman GÜRCAN
Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu
Özet:Bu çalışmada, kayısı, erik ve diğer sert çekirdekli meyveleri etkileyen en tahrip edici hastalık olarak değerlendirilen şarka hastalığına neden olan Plum pox virüsünün cDNA vektörleri Plum pox virüs M, Plum pox virüs D ve sadece Türkiye' ye özgü ırk olan Plum pox virüs T ırkları için elde edilmiştir. Virüs bulaşık doku örnekleri Kayseri, Aksaray ve İstanbul' dan toplanmıştır. Virüs ırkları gerçek zamanlı PZR ile belirlenmiş ve cDNAlar hem tesadüfi (random) hemde oligo dT primerleri kullanılarak RT PZR aracılığıyla oluşturulmuştur. Oluşturulan cDNAlar Plum pox virüs T, M ve D ırklarının tüm genomik DNAsını çoğaltmak için kalıp olarak kullanılmıştır. Her bir virüs genomunu klonlamak için Topo XL klonlama kiti kullanılmış ve ligasyon karışımı elektrokompetent E. coli hücrelerine aktarılımştır. Rekombinant plazmitleri içeren E. coli hücreleri seçici ortamda büyütülerek insörtü taşıdığı varsayılan koloniler alkali lizis metodu ile belirlenmiş ve plazmitler daha ayrıntılı analizler için izole edilmiştir. Plazmitlerde tüm genomik cDNAnın varlığı PZR ve in vitro transkripsiyon aracılığıyla doğrulanmıştır. Bu vektörler konak-virüs etkileşimlerinin çalışılmasında, dizi yönlendirilmiş mutagenez, RNA sessizleştirme, virüs replikasyonu, virüsün kısa ve uzun mesafeli hareketi, hastalığın gelişme mekanizması ve transgenik olmayan tarzda bitkilerde yabancı genlerin ekpresyonu çalışmalarında kullanılma potansiyeline sahiptir. Anahtar Kelimeler: Şarka hastalığı, Plum Pox virüs, bulaşıcı (enfektif) cDNA vektörü, klonlama, elektrotransformasyon