Dışkı örneklerinden Campylobacter spp. izolatlarının elde edilmesi ve bu izolatların antibiyotik duyarlılıklarının belirlenmesi
Tezin Türü: Yüksek Lisans
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Erciyes Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, BİYOLOJİ ANABİLİM DALI, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2023
Tezin Dili: İngilizce
Öğrenci: HUSSEIN ALI KAMIL
Danışman: PINAR SAĞIROĞLU, ABDURRAHMAN AYVAZ
Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu
Özet:Bu çalışma Erciyes Üniversitesi hastanelerine ishal şikâyeti ile başvuran hastalarda Campylobacter izolatlarının prevalansını belirlemek, antibiyotik direncini ortaya çıkarmak ve kinolon direncini genetik olarak saptamak amacıyla yapılmıştır. Erciyes Üniversitesi hastanelerine ishal şikâyeti ile başvuran bireylerden alınan dışkı örnekleri (150) mikrobiyoloji laboratuvarına gönderildi. Gaita örneklerinin ilk izolasyonunda gram boyama, son izolasyonunda ise selektif besiyeri kullanıldı. Kültürde üreyen Campylobacter izolatlarının tür düzeyinde teşhisi MALDI-TOF MS ile yapıldı, izolatların sırasıyla %82,4 (42/51) ve %17,6 (9/51) oranlarında C. jejuni ve C. coli oldukları belirlendi. İzolatların antibiyotik duyarlılık testleri (AST) Mueller Hinton Fastidious (MHF) agarda EUCAST tavsiyelerine göre disk difüzyon yöntemi ile yapıldı. Siprofloksasin, tetrasiklin ve eritromisin için sırasıyla %94 (47/50), %58 (29/50) ve %2 (1/50) direnç oranları belirlendi. C. jejuni suşlarının her üç antibiyotiğe karşı C. coli'den daha dirençli olduğu görüldü. Siprofloksasine dirençli izolatlardaki mutasyonları belirlemek için gryA geninin PCR ürünleri, spesifik bir primer kullanılarak mismatch amplifikasyon mutasyon testi (MAMA PCR) ile elde edildi ve dizi analizi yapıldı. Dizilenen 7 izolatın tamamında kinolon direncinin bir belirteci olan Thr-86 to-I mutasyonu gözlendi. Yine bu çalışmada 7 sessiz mutasyon 2 tane de novel mutasyon saptandı. incelenen dışkı örneklerinden %35,33 (53/150) oranında Campylobacter spp. izole edilmiş olup, pozitif izolatların çoğu (%64,15, 34/25) 0-10 yaş grubundan, özellikle erkeklerden elde edilmiştir (%75,5, 40/ 53). Anahter kelimeler: Campylobacter spp., kinolan direnci, MALDI-TOF MS, ADT, MAMA PCR