Akademik Veri Yönetim Sistemi
Tezin Türü: Yüksek Lisans
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Erciyes Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, BİYOLOJİ ANABİLİM DALI, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2018
Tezin Dili: İngilizce
Öğrenci: SHAHAD NAHEDH HUSSEIN HUSSEIN
Asıl Danışman (Eş Danışmanlı Tezler İçin): Abdurrahman Ayvaz
Eş Danışman: Salman Shaheer Ahmed Shaheer Ahmed
Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu
Özet:A. baumannii'de kolistin direncinin ortaya çıkması, Hastalık Kontrol ve Önleme Merkezi (CDC) tarafından endişe verici bir durum olarak kabul edilmektedir. Kolistin, A. baumannii'de çoklu ilaca dirençli son antibiyotiklerden biridir. Düzensiz antibiyotik kullanımı, farmakodinamik ve farmakokinetik özelliklerinin anlaşılmaması nedeniyle, bazı çalışmalar kolistin heterodirencinin ortaya çıktığını göstermekte ve bu durum kademeli olarak kolistin direncine yol açmaktadır. Heterodirenç, önceden duyarlı olan izolatların dirençli alt popülasyonlarının ortaya çıkması olarak tanımlanabilir. Kolistin direncinin ortaya çıkması klinik ve mikrobiyolojik sonuçları doğrudan etkilemektedir. Bu çalışmada, A.baumannii' nin klinik izolatlarında kolistin heterodirencinin belirlenmesi amaçlanmıştır. Bunun için çoklu ilaca dirençli Acinetobacter baumannii'ye ait toplam 15 klinik izolat balgam, idrar, kan, yara ve bronkoalveolar lavajdan izole edilmiştir. Bu izolatlar esas olarak Vitek 2 sistemi kullanılarak tanımlanmış ve PZR işlemiyle A. baumanii için blaOXA-51 gen markırı kullanılarak doğrulanmıştır. Çeşitli kolistin konsantrasyonu kullanılarak zaman-ölüm kinetik analizi yapılmış ve çeşitli zaman aralıklarındaki canlı koloniler sayılmıştır. Çeşitli konsantrasyonlarda (0.5, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 8 ve 10 µg / ml) hazırlanmış kolistin sülfat solüsyonundan 60 µl alınarak 24 saatlik bakteri hücre süspansiyonuna eklenmiş ve 48 saat sonra Popülasyon profil analizi belirlenmiş ve 11 gün boyunca seri pasaj işlemi gerçekleştirilmiş ve sonunda genetik profillemeyi belirlemek için RAPD-PZR analizi yapılmıştır. Ayrıca genomik DNA izolasyonu yapılarak DNA miktarı belirlenmiştir. Uygun primerler kullanılarak PZR analizi sonucunda toplam 15 klinik izolatın için blaOXA-51 geni taşıdığı belirlenmiştir. Referans suş ATCC 19606 ile 7 numaralı klinik izolatın artan kolistin konsantrasyonuna bağlı olarak zaman-ölüm kinetikleri belirlenmiş, ancak 0.5X MIC'da 2 saatte 4 koloni sayılmışken, 1X MIC'da sadece 3 koloni sayılmıştır. Popülasyon analiz profili sonucu toplam 15 klinik izolattan 6 tanesinin ve ATCC 19606 referans suşunun kolistin heterodirenci gösterdiği belirlenmiştir. RAPD-PZR yöntemi sonucunda 7 farklı genotipin varlığı ortaya çıkarılmıştır. Ayrıca bu çalışma sırasında bir zamanlar duyarlı olduğu bilinen A. baumannii kolonilerinde kolistin heterodirencinin varlığı belirlenmiştir. Heterodirenç belirlemek için daha ileri çalışmalara ihtiyaç vardır ve tüm genom sekanslama çalışmaları olayın moleküler kısmının da kuvvetli bir şekilde anlaşılmasını sağlayacaktır. Anahtar kelimeler: A. baumannii, heterorezistans, popülasyon analiz profili, kolistin