Peroksidaz Gen Markırları Kullanılarak Bazı Karpuz Çeşitlerinde Genetik Çeşitliliğin Belirlenmesi

---

Tezin Türü: Yüksek Lisans

Tezin Yürütüldüğü Kurum: Erciyes Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Türkiye

Tezin Onay Tarihi: 2012

Tezin Dili: Türkçe

Öğrenci: Necip Öcal

Eş Danışman: Osman GÜLŞEN

Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu

Özet:

Türkiye dünyada ikinci büyük karpuz üreticisidir, farklı bölgelerinde kayda değer miktarda yerel çeşitler ve ekotipler mevcuttur. Bu çalışma da, Çeltik genomundan geliştirilen 12 spesifik peroksidaz gen (POX) primeri 259 karpuz hattında peroksidaz gen polimorfizmini (POGP) belirlemek için kullanılmıştır. UPGMA metodu kullanılarak yapılan kümeleme analizleri sonucu karpuz genotiplerinin türler bazında gruplandığı, grupların oluşmasında coğrafi orijinlerinin etkili olmadığı belirlenmiştir. Temel bileşenler analizi (PCA) ile de benzer sonuçlar elde edilmiştir. Genotipler arasında genetik varyasyon bakımından 3 ayrı küme belirlenmiştir. Moleküler Varyans Analizi (AMOVA) ile coğrafi gruplar arasında %38.56, grup içinde populasyonlar arasında %7.39, populasyonlar içinde %54.06 varyasyon oranı tespit edilmiştir. Populasyonlar içi farklılıklar istatistiki olarak önemli (P<0.001) bulunmuştur. Bağlantı eşitsizliği (LD) testinde genotipik olarak farklı bireylerin oluşturduğu ikinci populasyonda LD yüksek çıkmış olup, markırlar arasında sıkı bağlantı tespit edilmiştir. Aynı türden bireylerin oluşturduğu diğer üç populasyonda ise düşük LD belirlenmiştir. Çalışılan genotipler de genetik polimorfizm oranı oldukça yüksek bulunmuştur (%98.2). Elde edilen polimorfizm oranı göz önüne alındığında karpuz hatlarında genetik çeşitliliğin ve evrimsel ilişkilerin araştırılmasında peroksidaz markırlar oldukça kullanışlıdır.