Adenosin bileşik serisinin anti-tümör aktivitesinin elektron konformasyon-genetik algoritma (EC-GA) yöntemi ile QSAR incelenmesi


Tezin Türü: Yüksek Lisans

Tezin Yürütüldüğü Kurum: Erciyes Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, KİMYA ANABİLİM DALI, Türkiye

Tezin Onay Tarihi: 2008

Tezin Dili: Türkçe

Öğrenci: YÜCEL YAZAR

Danışman: Emin Sarıpınar

Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu

Özet:

Adenosin bileşik serilerinin ?Elektron Konformasyonel -EC? metotu ile kantitatif aktivite tahmini yapılmıştır.Bu metot ile Pha, aktiviteyi artıran (AG) ve aktiviteyi azaltan (APS) grupların parametrelerinin bir fonksiyonu olarak kantitatif aktivite hesaplanabilir ve moleküllerin biyolojik maddelerle etkileşim mekanizmasının açıklanmasına yardımcı olur.Bu çalışmada konformasyonel analiz, elektronik yapı hesaplamaları ve matris karşılaştırması 21 bileşik için yapılmıştır. Bileşikler için elektron konformasyonel matrisi (ECMC) ESCP V1.0 programında hazırlandı. Farmakofor grubu belirlemek için elektron-konformasyonel alt matrisi (ECSA). Serisinde farmakofor grup N1, C2, N4, C7 ve C4 atomları olarak bulunmuştur. Bu bileşik serileri için bileşiklerin elektronik, geometrik ve fizikokimyasal özelliklerini gösteren parametreler Delphi dilinde yazılan EMRE V1.2 programında hazırlandı. Hazırlanan değişkenlerden yararlanarak Matlab programında genetik algoritma optimizasyon tekniği kullanılarak aktivite hesaplamaları yapıldı. Teorik olarak çıkan sonuçların deneysel sonuçlarla uyum içinde olduğu görülmüştür. Seride en aktif bileşik referans alınarak bileşiklerin aktivitesini en iyi veren parametreler bulunmuştur.Adenosin serisinde en iyi sonuç 18 parametre (kappa ) değeri ile elde edilmiş ve R2 değeri 1.0000 olarak hesaplanmıştır.