Akademik Veri Yönetim Sistemi
Tezin Türü: Yüksek Lisans
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Erciyes Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, TARIMSAL BİYOTEKNOLOJİ ANABİLİM DALI, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2019
Tezin Dili: Türkçe
Öğrenci: ONUR CANBULAT
Danışman: Kahraman Gürcan
Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu
Özet:HACIHALİLOĞLU KAYISI (Prunus armeniaca) ÇEŞİDİNDE TRANSKRİPTOM ANALİZİ Onur CANBULAT Erciyes Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü Yüksek Lisans Tezi, Haziran 2019 Danışman: Doç. Dr. Kahraman GÜRCAN ÖZET Kayısı (Prunus armeniaca) başta olmak üzere sert çekirdekli meyveler ulusal ekonomimizde önemli yere sahiptir. Ülkemiz özellikle dünya kurutmalık kayısı pazarında lider konumdadır. Kayısıda genetik, genomik ve transkriptom çalışmaları son yıllarda giderek artmıştır. Bu çalışmada 'Hacıhaliloğlu' kayısı çeşidin de, genç meyve, yaprak, çiçek, kök ve kotiledon dokularında transkriptom profili oluşturulmuştur. Illumina Novaseq6000 sistemi ile 100 bazlık çift-uçlu (pair-end) okumalar üretilmiş, her bir örnek için 40 milyon temiz okuma elde edilmiştir. Okumalar NCBI veri tabanın da kayıtlı şeftali (Prunus_persica_NCBIv2) referans genomuna eşleştirilmiş, trankriptler elde edilmiştir. Toplam 26.358 unigen tespit edilmiştir. Doku spesifik ve ortak olarak ifade edilen genler belirlenmiş ve gen ekspresyon seviyeleri karşılaştırılmıştır. Elde edilen transkriptom analiz sonuçlarının, kayısı ıslah ve genetik çalışmalarına katkı sağlayacağı düşünülmektedir. Anahtar Kelimeler: Kayısı (Prunus armeniaca), Transkriptom Analizi, RNA-seq