Isolation and characterization of multi drug resistant pseudomonas aeruginosa in ramadi province of western iraq


Tezin Türü: Yüksek Lisans

Tezin Yürütüldüğü Kurum: Erciyes Üniversitesi, Fen Fakültesi, Biyoloji, Türkiye

Tezin Onay Tarihi: 2019

Tezin Dili: İngilizce

Öğrenci: SAFAE ABDULHAMID BDAWI BDAWI

Danışman: Abdurrahman Ayvaz

Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu

Özet:

Bu çalışmada, AL-Ramadi Eğitim (Ramadi), Doğumevi ve Çocuk Eğitim Hastanesi (Ramadi) ve Karama (Bağdat) hastanelerinde yatan hastaların vücutlarının yara ve yanık bölgelerinden 2019 yılının Ocak, Şubat ve Mart ayları boyunca 176 adet swap örneği alınmıştır. İzolatların 53'ünün P. aeruginosa olduğu ve izolasyon oranının % 30,1 olduğu tespit edilmiştir. Bu izolatların 34'ü (% 19.31) yara örneklerinden izole edilirken, 19'u (% 10.76) yanıklardan izole edilmiştir. P. aeruginosa'nın tanısı için bakteri örnekleri kanlı agar, MacConkey agar ve Cetrimide agarlı besi yerlerinde kültüre alınmıştır. Yapılan mikroskobik, fenotipik ve biyokimyasal testler ile API 20E sistemi ile bakteri izolatlarının P. aeruginosa oldukları belirlenmiştir. Daha sonra bu P. aeruginosa izolatlarının antibiyotik direncini belirlemek için disk difüzyon yöntemi kullanılmış ve en etkili olanların Seftazidim ve Imipenem antibiyotiklei olduğu anlaşılmıştır. Test edilen izolatların Tetrasikline karşı oldukça dirençli olduklar belirlenmiştir. Bakterilerin Minimal İnhibisyon Konsantrasyonları (MIC) da VITEK2 sistemi ile belirlenmiştir. Dirençli oldukları belirlenen 12 adet izolat pelF ve blaTEM genleri bakımından RT-PCR ile taranmış ve yara örneklerinden elde edilen SEl ila SE7 izolatlarının, PelF primeri ile pozitif sonuç verdiği, SE8 izolatının ise bu geni taşımadığı görülmüştür. Yanık örneklerinden izole edilen izolatlardan sadece SE9 ve SE2 izolatlarının pelF genini taşıdığı bulunmuşur. Ayrıca bu dirençli izolatlar blaTEM geni açısından da değerlendirilmiş, yanık örneklerinden elde edilen izolatların hiçbirinin bu geni taşımadığı yara örneklerinden izole edilenlerden ise SE1, SE2, SE3 SE5 ve SE6 izolatlarının bu geni taşıdıkları bulunmuştur.