Akdeniz Ve Ege Bölgesi’nde Biber Yetiştiriciliği Yapılan Alanlarda Fusarium Solgunluk Hastalığının Yaygınlığı Ve Etmenin Moleküler Karakterizasyonu
Tezin Türü: Yüksek Lisans
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Erciyes Üniversitesi, Ziraat Fakültesi, Bitki Koruma, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2018
Tezin Dili: Türkçe
Öğrenci: Gamze YÜKSEL
Danışman: Hacer Handan Altınok
Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu
Özet:Ülkemizde Akdeniz ve Ege Bölgesi'nde Solanaceae familyasında yer alan domates, biber ve patlıcanda patojenik Fusarium oxysporum tür kompleksi (FOSC) önemli verim kayıplarına neden olmaktadır. Biber yetiştiricilik alanlarında son yıllarda Fusarium solgunluk etmeni Fusarium oxysporum f. sp. capsici (Foc) yaygınlaşmıştır. Akdeniz ve Ege Bölgesi'nde 2015 ve 2016 yıllarında biber sera ve tarlalarında sörvey çalışmaları yapılarak, biberde Fusarium solgunluk hastalığının yaygınlık durumu belirlenmiş ve elde edilen Foc izolatlarının virülenslikleri saptanmıştır. Her iki sörvey yılında da seraların %30, tarlaların ise %60 oranında solgunluk hastalığı ile enfekte olduğu saptanmıştır. Morfolojik olarak tanımlanan biber F. oxysporum izolatlarının moleküler tanısı da yapılmıştır. Makroskobik, mikroskobik incelemeler ve patojenisite denemeleri sonucunda toplam 64 izolat F. oxysporum f. sp. capsici (Foc) olarak saptanmıştır. Domates ve patlıcan fidelerine inoküle edilen Foc izolatları, çapraz inokulasyon denemelerinde solgunluk simptomu göstermemişlerdir. Hastalık şiddeti yüzdesine göre, 2015-2016 yılı sörveylerinden elde edilen 64 Foc izolatında üç ana virülenslik grubu tespit edilmiş ve bunların 17'si düşük-virülens, 24'ü orta-virülens ve 23'ü yüksekvirülens olarak değerlendirilmiştir. Toplam 40 adet Foc izolat seti ile birlikte konukçu dışı F. oxysporum izolatlarının tür içi ve türler arası filogenetik ilişkileri TEF1-alpha, Actin, Beta-tubulin, Calmodulin ve Chitin synthase primerleri ile belirlenmiştir. Bu gen bölgelerine ait sekans verileri üzerinden yapılan analizler sonucunda, Foc izolatları arasında sınırlı genetik varyasyon saptanmış ve F. oxysporum'un farklı f. spp. grupları birbirinden ayırt edilememiştir. Dendrogramda Foc izolatları aynı dalda yer alarak monofiletik bir grup oluşturmuştur. Bu çalışma, Türkiye'de biber üretim alanlarında Foc izolatlarının patojenik ve filogenetik analizine yönelik ilk kapsamlı araştırmadır. Anahtar Kelimeler: Biber, Fusarium solgunluğu, Patojenisite, TEF1-alpha, Actin