ÇEREZLİK KABAK POPULASYONLARININ GENETİK ANALİZİ


Tezin Türü: Yüksek Lisans

Tezin Yürütüldüğü Kurum: Erciyes Üniversitesi, Ziraat Fakültesi, Bahçe Bitkileri, Türkiye

Tezin Onay Tarihi: 2019

Tezin Dili: Türkçe

Öğrenci: Engin Oğuz Morilipınar

Danışman: Osman Gülşen

Özet:

Bu çalısma Kayseri ilinde yetistiriciligi yapılan farklı genotip kaynaklarında varyasyon

düzeyini arastırmak, genetik iliskileri tespit etmek ve baglantı esitsizligini belirlemek

amacıyla yapılmıstır. Çalısma kapsamında agırlıklı olarak Kayseri ilinin Develi,

Yesilhisar ve Tomarza ilçelerinden temin edilen 140 farklı çerezlik kabak genotipinin

genetik analizi yapılmıstır. DNA amplifikasyonu için 18 farklı ISSR primeri

kullanılmıstır. Bant veren ve skorlanabilen primerlerle tüm DNA örnekleri ile PCR

yapılmıstır. Toplamda kaydedilen 188 markır, NTSYS ve ARLEQUIN programı

kullanılarak analiz edilmistir. NTSYS’le UPGMA ve PCA analizleri, diger programla

da populasyon içi ve populasyonlar arası varyasyon dagılımını (AMOVA) görmek ve

baglantı esitsizligi durumunu tespit etmek amacıyla sırasıyla LD analizleri

gerçeklestirilmistir. LD analizleri çerezlik kabak populasyonlarında tespit edilen

markırlar arasında tesadüfi olmayan baglantıları tespit edebilmek için baglantı esitsizligi

(LD) analizleri yapılmıstır. Yürütülen bu çalısmada PCR çalısmaları ile elde edilen

analizler sonucunda ISSR primerleri ile elde edilen 188 markır için, toplam polimorfizm

oranı %98 olarak belirlenmistir. Yapılan NTSYS ve UPGMA analizleri sonucunda 140

genotip benzerlik düzeyinin 0.72 ortalama ile 0.47-0.97 arasında degistigi ve temelde 2

ana grup olusturdugu görülmüstür. AMOVA analizleri sonucunda ise toplam

varyasyonun %68’inin populasyon içinde %32’sinin ise populasyonlar arasında oldugu

tespit edilmistir. Bu sonuç ıslah programlarında hem populasyon içinin hem de farklı

populasyonların dikkate alınması gerektigini ortaya koymustur. LD analizlerinde ise

markırlar arasında yapılan baglantı analizlerinde farklı markırlarla baglantılı markır

sayııları degisken bulunmakla beraber markırlarla önemli karakterleri yöneten genler

açısından haritalama yapılabilcegini ortaya koymustur.