Sığırlarda blastocystis sp.'nin moleküler prevalansı ve genotiplendirilmesi ahmet tavur
Tezin Türü: Yüksek Lisans
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Erciyes Üniversitesi, Sağlık Bilimleri Enstitüsü, VETERİNERLİK PARAZİTOLOJİSİ ANABİLİM DALI, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2019
Tezin Dili: Türkçe
Öğrenci: AHMET TAVUR
Danışman: ZUHAL ÖNDER
Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu
Özet:Bu çalışmada, Kayseri yöresinde çeşitli mezbahalarda kesimi yapılan sığırlarda Blastocystis sp. enfeksiyonlarının direkt mikroskobik inceleme ve PCR analizleri ile araştırılması ve belirlenen izolatların moleküler karakterizasyonlarının yapılması amaçlanmıştır. Aralık 2018-Mayıs 2019 yılları arasında Kayseri yöresinde çeşitli mezbahalarda kesimi takiben farklı yaş ve ırkta toplam 150 sığırdan dışkı örnekleri toplanmıştır. Laboratuvarda dışkı örnekleri Blastocystis sp. yönünden Nativ-lugol yöntemi ile incelenmiştir. Tüm dışkı örneklerinden genomik DNA (gDNA) izolasyonları yapılmıştır. gDNA izolatlarında Blastocystis sp. DNA'sının aranmasında SSU rRNA gen bölgesini amplifiye eden spesifik primerlerle PCR analizleri gerçekleştirilmiştir. İncelenen sığır dışkılarının mikroskobik incelemesinde 52 örnekte Blastocystis sp. pozitifliği belirlenmiş ve Blastocystis sp. enfeksiyonlarının prevalansı %34,7 olarak tespit edilmiştir. PCR analizlerinde ise sığırların 88'i Blastocystis sp. yönünden pozitif belirlenmiş ve ilgili protozoonun moleküler prevalansı %58,7 olarak saptanmıştır. Pozitif belirlenen 35 izolat genotiplendirme ve filogenetik analizler için sekanslanmıştır. Sekans analizleri sonucu izolatların üç ayrı haplotipte oldukları belirlenmiş ve bu haplotipler ERU-Blast1-3 olarak isimlendirilmiştir. SSU rRNA gen bölgesi filogenetik analizinde ERU-Blast1-3 izolatlarının ruminant spesifik alt tip ST10'da bulundukları ve aynı alt tipte yer alan Türkiye ve çeşitli ülkelerde sığırlardan rapor edilmiş izolatlarla birlikte monofiletik küme oluşturdukları tespit edilmiştir. Sonuç olarak bu çalışma ile Kayseri yöresinde mezbahada kesimi yapılan sığırlarda Blastocystis sp. enfeksiyonlarının yaygınlığı belirlenmiş ve enfeksiyondan sorumlu parazitler üzerine moleküler epidemiyolojik veriler sağlanmıştır. Anahtar kelimeler: Alt tip, Blastocystis, moleküler karakterizasyon, prevalans, sığır