Akademik Veri Yönetim Sistemi
Tezin Türü: Yüksek Lisans
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Erciyes Üniversitesi, Ziraat Fakültesi, Bahçe Bitkileri, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2019
Tezin Dili: Türkçe
Öğrenci: Solmaz Kamaşak
Danışman: Osman Gülşen
Özet:
Bu çalısmanın amacı, gereksiz tekrarlardan arındırılmıs çekirdek karpuz (Citrullus
lanatus) koleksiyonunda mikrostaellite markörleri yardımıyla genetik iliskileri ortaya
koymak ve çesitli kabakgillerde gelistirilmis SSR primerlerlerinin profilleme
kabiliyetlerini ortaya koymaktır. Bu arastırma Erciyes Üniversitesi Üniversitesi Ziraat
Fakültesi Bahçe Bitkileri Bölümü labaratuvarında yürütülmüstür. Çalısmada
Türkiye’nin degisik bölgelerinden toplanmıs ve 4-6 kendilenerek saflastırılmıs
genotipler içerisinden, nitelikli özelliklere sahip olan 250 adet karpuz hattı arasından
daha önce yürütülen bir proje çerçevesinde seçilen 96 adet karpuz hattı kullanılmıstır.
Bu karpuzlardan CTAB metoduna göre genç yapraklardan DNA izole edilmistir.
Karpuz genotipleri arasındaki genetik iliskiyi belirlemek amacıyla daha önceki
çalısmalarda çesitli kabakgillerde çalısılmıs 79 adet SSR primer çifti kullanılmıstır.
Bant veren ve skorlanabilen primerlerle tüm DNA örnekleri ile PCR yapılmıstır. PCR
ürünleri Li-Cor firmasına ait olan 4300 DNA Analyzer cihazında akrilamid jele
yüklenerek büyüklüklerine göre ayrılmıs ve tüm jel görüntülerinde bantlar var (1) ve
yok (0) seklinde skorlanarak bunlara ait dosyalar olusturulmustur. PCR çalısmaları ile
elde edilen ürünlerin analizleri sonuçları NTYS ve UPGMA programlarında analiz
edilmistir. Yürütülen bu çalısmada test edilen 79 adet SSR primer çiftinden sadece 33
adedi kaydedilebilir bantlar üretmistir ve bu 33 primer çifti bütün karpuzlara
uygulanmıstır. PCR çalısmaları sonucunda SSR primerleri ile toplamda 67 bant elde
edilmis ve polimorfizm oranı 0.79 olarak belirlenmisitir. Yapılan UPGMA analizleri
sonucunda genotipler 0.84-1.00 düzeyinde benzerlik göstermistir. Primer basına tespit
edilen allel sayıları 1 ile 6 arasında farklılık göstermistir. Elde edilen toplam allel sayısı
bakımından CMCT44 (5 adet) ve Cgb4767 (6 adet) lokusları en fazla alleli üretmisitir.