THE EFFECT OF AKKERMANSIA MUCINIPHILA ON GUT BACTERIAL MICROBIOME, AND PROINFLAMMATORY RESPONSE, IN EXPERIMENTAL CAMPYLOBACTER JEJUNI INFECTION OF MICE
Tezin Türü: Yüksek Lisans
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Erciyes Üniversitesi, Sağlık Bilimleri Enstitüsü, VETERİNERLİK MİKROBİYOLOJİSİ ANABİLİM DALI, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2025
Tezin Dili: İngilizce
Öğrenci: KUTAY ŞEN
Danışman: Seçil Abay
Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu
Özet:Bu çalışmada, deneysel olarak Campylobacter jejuni (C. jejuni) ile enfekte edilen farelerde Akkermansia muciniphila (A. muciniphila) uygulamasının mikrobiyota kompozisyonu, intestinal histomorfoloji ve proinflamatuar sitokin düzeyleri üzerine etkilerinin araştırılması amaçlandı. Bu amaçla, toplam 72 erkek Balb/C faresi, her grupta dokuz fare olacak şekilde sekiz deney grubuna ayrıldı. Bir grup negatif kontrol grubu olarak belirlendi ve hiçbir uygulama yapılmadı, bir gruba ise yalnızca A. muciniphila oral yoldan verildi. Geriye kalan altı grup ise C. jejuni enfeksiyon modelini oluşturdu; bunlardan üç grup standart suşla (NCTC 11168), üç grup ise saha suşuyla (tavuk karkasından izole edilen ve çoklu ilaç direncine sahip) oral yoldan enfekte edildi. Bu gruplara, oral C. jejuni suşlarının inokülasyonundan önce intestinal disbiyozis sağlamak amacıyla üç gün boyunca (sıfırıncı günden üçüncü güne kadar) 0,1 mL vankomisin (50 mg/ml) oral yoldan uygulandı. Daha sonra, standart ve saha suşu gruplarına ait üç gruba yerleştirilen farelere dördüncü günde 1x107 CFU/mL C. jejuni suşu oral yoldan uygulandı. Gruplardaki C. jejuni'nin intestinal kolonizasyonu, C. jejuni inokülasyonundan sonraki ikinci günde kültürel yöntemle doğrulandı. Tedavi için, C. jejuni standart suşu veya saha suşu ile oral yoldan aşılanan üç fare grubunun her birine, C. jejuni bağırsak kolonizasyonunun doğrulandığı ikinci günden itibaren sırasıyla A. muciniphila, eritromisin ve fosfat tamponlu salin uygulandı. Deney gruplarında belirtilen bu uygulamalar 9 gün boyunca devam etti. Deney süresince, C. jejuni için kültürel analizler yapmak amacıyla farelerden 0, 4, 6, 10, 12 ve 14. günlerde dışkı örnekleri, mikrobiyom analizleri yapmak amacıyla ise 0, 4 ve 14. günlerde dışkı örnekleri toplandı. Her gruptan üç fare çalışmanın 10, 12 ve 14. günlerinde ötenazi edildi. Ayrıca her ötenazi döneminde histomorfolojik ve serolojik analizler için farelerden bağırsak dokusu ve kan örnekleri toplandı. Mikrobiyom analizi, A. muciniphila takviyesinin mikrobiyal çeşitliliği, özellikle alfa çeşitliliğini geri kazandırdığını gösterdi. Bu çeşitlilik, yalnızca A. muciniphila verilen grupta ve kontrol grubunda en yüksekti. Buna karşılık, eritromisinle tedavi edilen gruplar bakteri çeşitliliğinde önemli azalmalar gösterdi. Beta çeşitliliği, gruplar arasında bakteri topluluk yapısında istatistiksel olarak önemli değişiklikler ortaya koymadı. Sekumun histolojik incelemeleri tüm gruplarda patolojik değişiklik göstermedi. Kontrol grubundaki fareler ve enfekte fareler iyi korunmuş villus, kript ve glandüler yapıları korudu ve bu da A. muciniphila uygulamasının doku hasarına neden olmadığını doğruladı. Sonuçlar, A. muciniphila'nın serum İnterlökin-1β, İnterlökin-6 ve Tümör Nekroz Faktörü-α düzeylerini önemli ölçüde azalttığını, anti-inflamatuar etkilerinin özellikle İnterlökin-6 ve Tümör Nekroz Faktörü-α için daha uzun uygulama sürelerinde daha belirgin olduğunu ortaya koydu. C. jejuni ile enfekte olmuş farelerde, A. muciniphila uygulaması, özellikle ikinci ve üçüncü ötanazi noktalarında, eritromisin tedavisine kıyasla daha fazla İnterlökin-1β ve Tümör Nekroz Faktörü-α azalmasına neden oldu. Bu çalışma, A. muciniphila'nın yalnızca A. muciniphila uygulanan grupta ve C. jejuni ile enfekte olmuş farelerde önemli anti-inflamatuar ve mikrobiyota onarıcı ve bağırsak histomorfolojik koruyucu özellikler sergilediğini ortaya koydu. Yedi ve dokuz gün boyunca A. muciniphila uygulamasının olumlu etkileri, eritromisin tedavisinin etkilerinden daha iyiydi. Sonuç olarak, A. muciniphila'nın bağırsak sağlığı için C. jejuni enfeksiyonunda güvenli ve etkili bir yeni nesil probiyotik olarak kullanılma potansiyeline sahip olabileceği düşünülmektedir. Anahtar Kelimeler: Akkermansia muciniphila; Bağırsak histomorfolojisi; Bağırsak mikrobiyomu; Campylobacter jejuni; Proinflamatuar sitokinler