Tavuk Etlerinde Arcobacter spp. Varlığı İzolatların Antibiyotik Duyarlılıkları Ve Moleküler Tiplendirilmesi


Tezin Türü: Yüksek Lisans

Tezin Yürütüldüğü Kurum: Erciyes Üniversitesi, Veteriner Fakültesi, Gıda Hijyeni ve Teknolojisi, Türkiye

Tezin Onay Tarihi: 2023

Tezin Dili: Türkçe

Öğrenci: Özgün Taşlı

Danışman: Harun Hızlısoy

Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu

Özet:

Bu çalışmada; Kayseri'de çeşitli market ve satış yerlerinde satışa sunulan tavuk etlerinde Arcobacter spp. varlığı, izolatların belirlenen antibiyotiklere duyarlılıkları ve izolatların moleküler tiplendirilmesi amaçlanmıştır. Çalışmada Kayseri ilindeki tavuk eti satış yerlerinden toplam 100 adet tavuk eti örneği (bütün tavuk (n=25), but (n=25), kanat (n=25), göğüs eti (n=25)) toplanarak materyal olarak kullanılmıştır. Tavuk eti örneklerinden Arcobacter spp.'lerin izolasyonu amacıyla önzenginleştirme ve membran filtrasyon işlemleri yapılmıştır. Arcobacter spp.'lerin identifikasyonu fenotipik testler ve multipleks polimeraz zincir reaksiyonu (mPCR) ile gerçekleştirilmiştir. Arcobacter spp.'lerin çeşitli antibiyotiklere karşı direnç durumunun ortaya konması amacıyla disk difüzyon testi yapılmıştır. İzolatlar arasındaki genetik ilişkilerin araştırılması için Enterobacterial Repetitive Intergenic Consensus Polymerase Chain Reaction (ERIC-PCR)' den yararlanılmıştır. Çalışma sonucunda toplanan 100 adet tavuk eti numunesinden 23 (%23) şüpheli koloni elde edilmiş. Bu şüpheli kolonilere yapılan fenotipik testlerle bu 23 izolatın Arcobacter spp. olduğu tespit edilmiştir. Moleküler identifikasyon testleri sonunda 23 izolattan 3'ü A. cryaerophilus, 20 izolat ise A. butzleri yönünden pozitif olarak identifiye edilmiş, fakat A. skirrowi türü bulunamamıştır. Yapılan disk difüzyon testi sonunda, izolatların sırasıyla 12'si (%52.17) eritromisine, 13 (%56.52)' ü amoksisilin-klavulanik asite, 20 (%86.95)'si trimetoprim/sülfametaksazole, 20 (%86.95)' si ampisiline, 8 (%34.78)' i enrofloksasine, 2 (%8.69)' si tetrasikline, 5 (%21.73)' i streptomisine, 16 (%69.56)' sı azitromisine ve 21 (%91.3)' inin de neomisine dirençli olduğu tespit edilirken, gentamisine tüm izolatların duyarlı olduğu saptanmıştır. Bu izolatların 2'si 3 (%9.09), 3'ü 4 (%13.63), 6' sı 5 (%27.27), 8' i 6 (%36.36), 3'ü ise 7 (%13.63) antibiyotiğe karşı çoklu direç göstermiştir. ERIC-PCR ile A. butzleri ve A. cryaerophilus izolatlarına ait amplikonlar kendi aralarında ayrı ayrı yürütülüp değerlendirilmiştir. İzolatlardan elde edilen bant profillerinin birbirinden farklılık gösterdiği saptanmıştır. Bant sayılarının 1 ila 9 arasında değiştiği ortaya konmuştur. Sonuç olarak, yaygın bir şekilde tüketilen kanatlı etlerinde, birçok antibiyotiğe dirençli Arcobacter spp.' lerin varlığı insanlarda gastroenterit ve ekstra intestinal hastalıklardan izole edilmeleri sebebiyle halk sağlığı açısından önem arz etmektedir. Bu nedenle kanatlı karkaslarının etken ile kontaminasyonun önlenmesi ve gıdaların üretimi, işlenmesi, depolanması ve satışı hakkında personelin eğitilmesinin, kanatlı etlerinden kaynaklanan hastalıkları engellemekte önemli rol oynayacağı kanaatindeyiz.