Bacillus cereus, B. tubtilis ve B. thuringiensis türü bakterilerin mısırda (Zea mays L.) protein ifade profili üzerine etkisinin araştırılması


Tezin Türü: Yüksek Lisans

Tezin Yürütüldüğü Kurum: Erciyes Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, TARIMSAL BİYOTEKNOLOJİ ANABİLİM DALI, Türkiye

Tezin Onay Tarihi: 2019

Tezin Dili: Türkçe

Öğrenci: DİLEK GÖKÇEK

Danışman: Semih Yılmaz

Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu

Özet:

Serbest yaşayan, bitki gelişimini teşvik eden ve biyolojik savaş ajanı olarak kullanılabilen PGPR'ler son 30 yıldan fazla süredir tarımda kullanılmaktadır. PGPR grubunda olan Bacillus türü bakterilerin bitkilere uygulanması hakkında yürütülen araştırmalarda bitkiler üzerinde önemli verim artışları olduğu bildirilmiştir. Yapılan bu tez çalışmasının amacı Bacillus cereus, B. subtilis ve B. thuringiensis bakterilerinin önemli tahıl grubundan olan mısır (Zea mays L.) bitkisinde verim, gelişim ve protein ifade profilinde oluşturduğu farklılıkların belirlenmesidir. Araştırmada ACC deaminaz, fosfataz ve siderofor taşdığı bilinen yerel bakteriler mısır tohumlarına kaplama şeklinde uygulanmış ve bitki fiziksel gelişimi incelemeleri için verim parametreleri belirlenmiştir. Bitkilerin en üst kısımdaki taze yapraklarından protein extraksiyonu yapılmış SDS-PAGE ve 2D analizleri ile protein farklılıkları belirlenmiştir. Elde edilen sonuçlarda klorofil içeriği bakteri uygulanan mısır bitkilerinde kontrole göre önemli bulunmuştur (p<0.05). Ayrıca kök yaş ağırlıkları bakteri uygulanan mısır bitkilerinde kontrol bitkilerine göre istatiksel olarak yüksek bulunmuştur (p<0.05). Yine sürgün yaş ağırlıklarıda bakteri uygulanan bitkilerde kontrol bitkilerine göre istatiksel olarak yüksek bulunmuştur (p<0.05). SDS-PAGE ve 2D de Bacillus sp. KH16.2 (MH847787), Bacillus thuringiensis SY49.1 (MW197418) ve Bacillus sp. KH6.4 bakteri uygulamaları yapılan bitkilerde kontrole göre artış ve azalış yönünde ifade farklılıkları belirlenmiştir. Sonuç olarak mısır bitkisine uygulanan bakterilerin hem verim parametrelerinde hem de protein ifade profilinde farklılık oluşturduğu belirlenmiştir.