Akademik Veri Yönetim Sistemi
Tezin Türü: Yüksek Lisans
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Erciyes Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2006
Tezin Dili: Türkçe
Öğrenci: Kader Şahin
Asıl Danışman (Eş Danışmanlı Tezler İçin): Ilhan Özer İLHAN
Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu
Özet:III2-FENİLİNDOL TÜREVLERİNİN GÖRECELİ BAĞLANMA EĞİLİMLERİNİN6D QSAR ANALİZİ OLARAK CoMCET PROGRAMIYLA İNCELENMESİKader ŞAHİNErciyes Üniversitesi, Fen Bilimleri EnstitüsüYüksek Lisans Tezi, Temmuz 2006Tez Danışmanı: Yrd. Doç. Dr. İlhan Özer İLHANÖZETNon steroidal östrojen reseptör (ER) ligandlarının üç boyutlu nicel yapı aktiviteilişkisini (3D QSAR) ortaya koymak için yeni geliştirilmiş ?Comparative MolecularConformer Electron Topological (CoMCET)? metodu kullanılmıştır. Östrojenreseptör için ligandların göreceli bağlanma eğilimlerinin (RBA) tanımlandığı bumodel, ligandların sterik ve elektrostatik özelliklerini düşünmek için kullanılmıştır.Bu model kullanılarak CoMCET'den elde edilen sonuçlar 2-fenilindol türevlerininRBA değerleri ile karşılaştırılmıştır. Tüm bunlar östrojen analoglarına benzeyenCoMCET'teki bileşiklerin yapısal özelliklerini belirlemek ve ER ligandlarınınbağlanma türlerini daha ileri düzeyde açıklamak için yapılan bir çalışmadır. Her birmolekülün kararlı hal konformerini bulmak için yapılan moleküler dinamikhesaplamaları ve enerji minimizasyonundan sonra konformerlerin kuantumkimyasal özellikleri CoMCET metodunda referans molekülün matrisleri ile ilgilikonformerin matrisini karşılaştırma işlemine dönüştürülmüştür. Bu metotmoleküllerin aktivitelerini tahmin etmek kadar onların biyolojik etkileşimmodellerinin anlaşılmasında da önemli bir ilerleme sağlar. Estradiol bileşiklerininkonformerlerini süperimpoz yaparak (aynı fonksiyonel atomları çoklukla birbiriüzerinde çakıştırarak) moleküllerin tüm çiftleri arasındaki benzerlik indislerimatrisinden Pha N1, C8 ve C9 atomları olarak belirlenmiştir. Pha atomları üst üsteçakıştırıldıktan sonra AG (auxiliary groups) ve APS (anti-pharmacophore shielding)grupları için hipotez yürütülür. Estradiol bileşikleri için biyoaktivitenin nicelformülündeki kimyasal fonksiyonların geometrik bir düzenlemesi olarak AG, C2 veC6 atomlarından , APS ise C3, C16 ve O2 atomlarından oluşmaktadır. Bu seri içinR2= 0,89; se (standart hata) = 0,40 olarak bulunmuştur.Anahtar Kelimeler: İlaç tasarımı, nicel yapı-aktivite ilişkisi; QSAR, elektrontopolojik metot, farmakofor, Pha.,CoMCET