Akademik Veri Yönetim Sistemi
Tezin Türü: Doktora
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Erciyes Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, KİMYA ANABİLİM DALI, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2018
Tezin Dili: Türkçe
Öğrenci: SEMİHA KÖPRÜ
Danışman: Emin Sarıpınar
Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu
Özet:Bu çalışmada fenilpirazin, alkinilfenoksiasetik asit ve ftalazin Türevlerinin aktivitesinden sorumlu farmakofor gruplarının belirlenmesi ve bileşik serilerinin biyoaktivite tahmini elektron konformasyonel genetik algoritma (EC-GA) metodu kullanılarak yapılmıştır. Bu kapsamda farmakofor grubu belirlemek ve biyolojik aktivite hesaplamaları için 4D-QSAR yazılım paketi (EMRE, ECSP ve MATLAB kodları) geliştirilmiştir. Serilerdeki tüm bileşikler için kuantum kimyasal hesaplamalar ve konformasyonel analizleri semiempirik-PM3/HF-6-31G* metodu kullanılarak (sulu ortamda) Spartan 10 paket programında yapılmıştır. Hesaplamalar sonucunda elde edilen veriler kullanılarak EMRE programı ile her bir konformer için üç boyutlu elektron konformasyonel uygunluk matrisleri (ECMC) hazırlanmıştır. Sonra ECSP programı ile farmakofor grup olarak adlandırılan elektron konformasyonel alt matris (ECSA) belirlenmiştir. Fenilpirazin, alkinilfenoksiasetik asit ve ftalazin serilerindeki bileşiklerin her bir konformeri için moleküler parametreler EMRE programı ile hazırlanmıştır. Teorik aktivite değerlerini bulmak ve aktiviteye etki eden en önemli parametre gruplarının belirlenmesi için genetik algoritma ve doğrusal olmayan en küçük kareler (lsqnonlin) yöntemi kullanılmıştır. Seriler, eğitim ve test seti olmak üzere sınıflandırılarak istatistiksel analizleri yapılmıştır. Fenilpirazin, alkinilfenoksiasetik asit ve ftalazin serilerinin R2eğitim, R2test değerleri için sırasıyla 0.868, 0.900, 0.858, 0.857, 0.829, 0.797 bulunmuştur. Bu seriler için çapraz doğrulama katsayıları (q2) değerleri ise sırasıyla 0.794, 0.810, 0.757'dir. Anahtar Kelimeler: 4D-QSAR, EC-GA, Fenilpirazin, Alkinilfenoksiasetik Asit, Ftalazin, Farmakofor, Genetik Algoritma.