İlaç Tasarımında 4d-Qsar Elektron Konformasyonel-Genetik Algoritma (Ec-Ga) Metodu: Bilgisayar Destekli Emre Yazılımı Ve Uygulamaları


Creative Commons License

Sarıpınar E., Köprü S., Çağlar Yavuz S.

1. İlaç Kimyası, Üretimi, Teknolojisi, Standardizasyonu Kongresi, Antalya, Turkey, 29 - 31 March 2013, pp.26-36, (Full Text)

  • Publication Type: Conference Paper / Full Text
  • City: Antalya
  • Country: Turkey
  • Page Numbers: pp.26-36
  • Erciyes University Affiliated: Yes

Abstract

Özet: Elektron Konformasyonel (EC) ve Genetik Algoritma optimizasyon (GA) metotları tarafımızdan birleştirilerek ilaç tasarımında oldukça başarılı olan yeni bir hibrid metod (EC-GA) geliştirilmiştir Bileşiklerin muhtemel bütün konformerlerinin dikkate almasından dolayı bir 4D-QSAR metodu olan bu yöntem, biyolojik aktiviteden sorumlu farmakofor grubunun belirlenmesinin yanı sıra, aynı aktif gruba sahip bileşiklerin farklı aktivite göstermesine etki eden yapısal matrikleri, elektronik ve topolojik özellikleri karşılaştırılarak aktiviteye etki eden parametreler EC-GA ile belirlenmektedir. Geliştirdiğimiz bu metodun sistematik ilaç tasarımına kolaylıkla uygulanabilmesi için EMRE olarak adlandırdığımız yazılımlar geliştirilmiştir. Yöntemin en önemli özelliklerinden biride, enantiomerlerin de aktivitesinin belirlenebilmesidir. Bu yöntemin güvenirliği Penicilin, benzotriazin, 1,4-Dihidropiridin TİBO, HEPT, Ruthenyum kompleksleri gibi çok sayıda bileşik serisine uygulanarak ortaya konulmuştur.