Akademik Veri Yönetim Sistemi
24. Ulusal Kimya Kongresi, Zonguldak Karaelmas Üniversitesi, Zonguldak, Türkiye, 29 Haziran - 02 Temmuz 2010, ss.1, (Özet Bildiri)
Bu çalışmada Hepatit C inhibitörü olan Kinolin türevi [1] bileşik serisinin Elektron
Konformasyon-Genetik Algoritma (EC-GA) ile kantitatif aktivite hesaplaması ve farmakofor
(Pha) grubu tanımlaması yapılmıştır. Bileşik serisinin deneysel aktiviteleri ilgili literatürden
alınmıştır.[1]Çalışmanın ilk kısmında, Spartan 06 programı kullanılarak 111 adet bileşiğin
konformasyonel analizi Hartree-Fock 3-21G metodu ile yapılmıştır. Bu hesaplamalar
sonucunda elde edilen verilerden yararlanılarak EMRE V2.0 programı ile her bir konformer
için üç boyutlu elektron konformasyonel uygunluk matrisleri (ECMC) hazırlanmıştır. Daha
sonra ECSP programı ile bu matrisler belirli tolerans değerlerinde karşılaştırılarak aktiviteden
sorumlu olan farmakofor grup yani elektron konformasyonel alt matris (ECSA) belirlenmiştir.
Moleküler parametreler her bir bileşiğin her bir konformeri için EMRE V2.0 programı ile
hazırlanmıştır. İnhibisyon aktivitelerine etki eden en önemli parametre gruplarının
belirlenmesi ve teorik aktivite değerlerinin bulması için genetik algoritma ve doğrusal
olmayan en küçük kareler yöntemi kullanılmıştır. Ayrıca bileşikler eğitim ve test seti olmak
üzere ikiye ayrılarak optimizasyon yapılmıştır.Modelin önerme gücünün geçerliliğinin
ölçülmesi için Leave –One Out Cross Validation işlemi uygulanmıştır.