Köpek Dışkı Örneklerinden Vankomisin Dirençli Enterococcus faecalis ve Enterococcus faecium’un İzolasyonu, İdentifikasyonu ve Elde Edilen İzolatların Genotiplendirilmesi

Karakaya E., Güran Ö., Sığırcı Y., Bolat N. N., Güran C.

XVII. Ulusal Veteriner Hekimleri Mikrobiyoloji Kongresi (Uluslararası Katılımlı), Ankara, Türkiye, 6 - 08 Ekim 2026, ss.28, (Özet Bildiri)

  • Yayın Türü: Bildiri / Özet Bildiri
  • Basıldığı Şehir: Ankara
  • Basıldığı Ülke: Türkiye
  • Sayfa Sayıları: ss.28
  • Erciyes Üniversitesi Adresli: Evet

Özet

Bu çalışmada, sağlıklı köpeklerin dışkı örneklerinden vankomisin dirençli Enterococcus faecalis ve Enterococcus faecium izolasyonu, elde edilen izolatların fenotipik ve moleküler identifikasyonu ile izolatların ERIC-PCR (Enterobacterial Repetitive Intergenic Consensus Polymerase Chain Reaction) yöntemiyle genotiplendirilmesi amaçlandı. Bu amaçla, Kayseri’de faaliyet gösteren kliniklere getirilen 100 sağlıklı köpekten dışkı örnekleri toplandı. Örnekler vankomisin içeren Enterococci Broth’ta zenginleştirildikten sonra Enterococcus Selective Agar ve Bile Esculin Azide Agar’a ekildi ve 37°C’de, aerobik ortamda, 48-72 saat inkübe edildi. İnkübasyon süresi sonunda, şüpheli koloniler (kırmızı ve kahverengi-siyah renkli koloniler) değerlendirmeye alınarak, %7’lik koyun kanlı agarda saf kültürleri elde edildi. Elde edilen izolatların identifikasyonu amacıyla, fenotipik testler (Gram boyama, hareket, katalaz, oksidaz, laktoz ve H2S) ve moleküler analizler (genus ve tür spesifik PCR) gerçekleştirildi. E. faecalis ve E. faecium izolatlarının klonal ilişkisi ERIC-PCR ile analiz edildi. Çalışma sonucunda, 100 dışkı örneğinin %41’i Enterococcus spp. yönünden pozitif bulundu ve toplam 47 Enterococcus spp. izolatı elde edildi. Fenotipik ve moleküler identifikasyon sonucunda elde edilen izolatların 6’sı E. faecalis ve 3’ü ise E. faecium olarak tanımlandı. ERIC-PCR analizi sonucunda, 3 E. faecium izolatının tek bir genotipik profil sergileyerek klonal yakınlık gösterdiği saptandı. Buna karşın, E. faecalis izolatları ERIC-PCR ile genotiplendirilemedi. Sonuç olarak, sağlıklı köpeklerin bağırsak mikrobiyotasında klinik açıdan önem taşıyan vankomisin dirençli E. faecalis ve E. faecium’un düşük oranlarda bulunduğu belirlenmiş olup, evcil hayvan popülasyonlarında bu iki türün epidemiyolojisi ve klonal dinamiklerinin moleküler düzeyde izlenmesinin yararlı olacağı değerlendirildi.

This study aimed to isolate vancomycin-resistant Enterococcus faecalis and Enterococcus faecium from fecal samples collected from healthy dogs, characterize the recovered isolates by phenotypic and molecular methods, and assess their genotypic relatedness using ERIC-PCR (Enterobacterial Repetitive Intergenic Consensus-Polymerase Chain Reaction). For this purpose, fecal samples were collected from 100 healthy dogs brought to veterinary clinics in Kayseri, Türkiye. Following enrichment in Enterococci Broth supplemented with vancomycin, the samples were inoculated onto Enterococcus Selective Agar and Bile Esculin Azide Agar and incubated aerobically at 37°C for 48-72 hours. At the end of the incubation period, suspected red and brown-black colonies were evaluated, and pure cultures were obtained on 7% sheep blood agar. For identification of the recovered isolates, phenotypic tests (Gram staining, motility, catalase, oxidase, lactose, and H₂S tests) and molecular analyses (genus- and species-specific PCR) were performed. The clonal relationships among the E. faecalis and E. faecium isolates were analyzed using ERIC-PCR. As a result of the present study, 41% of the 100 fecal samples were found to be positive for Enterococcus spp., and a total of 47 Enterococcus spp. isolates were recovered. In the phenotypic and molecular identification, six of the isolates were identified as E. faecalis and three as E. faecium. ERIC-PCR analysis revealed that three E. faecium isolates exhibited a single genotypic profile, showing clonal proximity. In contrast, E. faecalis isolates could not be genotyped by ERIC-PCR. In conclusion, it was determined that clinically significant vancomycin-resistant E. faecalis and E. faecium are present at a low rate in the gut microbiota of healthy dogs, and it was considered that monitoring the epidemiology and clonal dynamics of these two species at the molecular level in pet populations would be beneficial.