Akademik Veri Yönetim Sistemi
3.İlaç Kimyası: İlaç Etkin Maddesi Tasarımı, Sentezi, Üretimi ve Standardizasyonu Kongresi, 20-22 Mart 2015, Antalya, Antalya, Türkiye, 20 - 22 Mart 2015, ss.39-40, (Özet Bildiri)
C2-aril pirolo [2,1-c][1,4] benzodiazepin (PBD) bileşikleri antibiyotik ve antitümör özelliğiyle bilinen Streptomyces türlerinin fermantasyonundan izole edilmiştir. Benzodiazepinler psikofizyolojik semptomları içeren hastalıkların tedavisinde sıklıkla kullanılan ilaçlardır. Bu çalışmada grubumuz tarafından geliştirilen Elektron Konformasyonel Genetik Algoritma (ECGA)1 metodu kullanılarak benzodiazepin serisine2 ait bileşiklerin biyolojik aktivitesinden sorumlu farmakofor grubu bulunmuş ve nicel aktivite tahmini yapılmıştır. Kuantum kimyasal hesaplamalar HF 3-21 G* metodu (sulu ortamda) yapılarak serideki bileşiklerin bütün konformerleri için Elektron Konformasyonel Uygunluk Matrisleri (ECMC) hazırlanmıştır. EMRE programı kullanılarak ECMC’ler belirli tolerans değerleri içerisinde karşılaştırılıp benzodiazepin bileşikleri için aktiviteden sorumlu farmakofor grubu bulunmuştur. Bu bileşikler için inhibisyon aktivitelerine etki eden parametre gruplarının belirlenmesi için genetik algoritma metodu kullanılmıştır. Bileşikler eğitim ve test seti olarak sınıflandırılarak seride modeller kullanılmıştır. Modellerin doğruluğu çapraz doğrulama ve istatistiksel olarak yapılmıştır. (Aşağıdaki şekilde N1 N2 C14 düzlemine O3 atomunun dik uzaklığı parametresi gösterilmiştir.)