Akademik Veri Yönetim Sistemi
3.İlaç Kimyası: İlaç Etkin Maddesi Tasarımı, Sentezi, Üretimi ve Standardizasyonu , Antalya, Türkiye, 20 - 22 Mart 2015, ss.9-10, (Özet Bildiri)
Alkinilfenoksiasetik Asit Türevlerinin Elektron-Konformasyon Genetik Algoritma (EC-GA) Yöntemi ile 4D-QSAR Analizi
Semiha KÖPRÜ, Emin SARIPINAR Erciyes Üniversitesi, Fen Fakültesi, Kimya Bölümü,38039 Kayseri semihaaydin@erciyes.edu.tr
Alkinilfenoksiasetik Asit türevleri1 DP2 ( Prostaglandin D2) inhibitörleri olarak bilinir ve bu sınıf bileşikler alerjik iltihabi hastalıkların tedavisinde kullanılmaktadır. Bu çalışmada Elektron Konformasyon Genetik Algoritma2 (EC-GA) metodu kullanılarak Alkinilfenoksiasetik Asit türevi bileşiklerin biyolojik aktivitesinden sorumlu farmakofor grubun belirlenmesi ve nicel aktivite tahmini yapılmıştır. Çalışmanın ilk kısmında, Spartan programı ile 121 adet bileşiğin (2500 konformer) konformasyonel analiz ve kuantum kimyasal hesaplamaları Hartree-Fock 6-31G* metodu ile yapılmıştır. Bu hesaplamalar sonucunda elde edilen verilerden yararlanılarak EMRE programı ile her bir konformer için üç boyutlu elektron konformasyonel uygunluk matrisleri (ECMC) hazırlanmıştır. ECSP programı ile bu matrisler belirli tolerans değerlerinde karşılaştırılarak aktiviteden sorumlu olan farmakofor grup yani elektron konformasyonel alt matris (ECSA) belirlenmiştir. Aktiviteyi artıran yada azaltan elektronik, geometrik, fizikokimyasal parametreler EMRE programı ile hazırlanmıştır. Bu seri eğitim ve test seti olarak ikiye bölünerek optimizasyonu yapılmıştır. Modellerin geçerliliğini ve güvenirliğini doğrulamak için LOO-çapraz doğrulama, regresyon, dahili ve harici doğrulama ve uyum korelasyon katsayısı (CCC) analizleri istatiksel olarak yapılmıştır. Aktiviteye etki eden ve genetik algoritma ile bulunan en uygun alt parametre setindeki her bir parametrenin katkısını bulmak için E istatistik yöntemi uygulanmıştır.