DETERMINATION OF TRANSFERABILITY OF GENOMIC SSR MARKERS DEVELOPED IN CULTIVATED LENTIL (LENS CULINARIS MEDIK.) TO WILD LENTIL SPECIES


KEKLİK M., BAKIR M.

IV - INTERNATIONAL CONFERENCE OF FOOD, AGRICULTURE, AND VETERINARY SCIENCES, Van, Türkiye, 27 Mayıs 2022

  • Yayın Türü: Bildiri / Özet Bildiri
  • Basıldığı Şehir: Van
  • Basıldığı Ülke: Türkiye
  • Erciyes Üniversitesi Adresli: Evet

Özet

ple sequence repeats (SSRs) markörler, bitki genetik ve genomik araştırmaları için yaygın olarak

geliştirilen ve kullanılan önemli moleküler gereçlerdir. Ancak mikrosatellitlerin geliştirilmesi yüksek

maliyeti ve iş gücü nedeniyle, bitkilerde yaygın olarak kullanımını sınırlamaktadır. Bu nedenle bir türde

geliştirilen SSR markörünün, tür içi ve türler arası aktarılabilirliğinin tespiti, genetik ve genomik

çalışmalara kolaylık sağlamaktadır. Bu çalışmanın amacı, kültür mercimeğinde geliştirilen SSR

markörünün yabani mercimek türleri L. nigricans, L. lamottei, L. ervoides, L. culinaris subsp.

tomentosus, L. culinaris subsp. orientalis, L. culinaris subsp. odemensis’e transfer edilebilirliğini

belirlemektir. Bunun için kültür mercimeğinde geliştirilen 100 SSR markörü test edilmiştir. Test edilen

bu markörlerin yabani mercimek türlerindeki polimorfizm oranları sırasıyla %41 (L. nigricans), %40

(L. culinaris subsp. tomentosus), %39 (L. culinaris subsp. orientalis), %34 (L. culinaris subsp.

odemensis), %34 (L. ervoides) ve %31 (L. lamottei) olarak belirlenmiştir. Polimorfizm gözlemlenen

markörlerin ise %51 (21)’inin tüm türlerde ortak çalıştığı tespit edilmiştir. Ortak polimorfizm gösteren

bu markörlerin beklenen heterozigotluk (He) oranının ortalama 0.657 olduğu, gözlenen heterozigotluk

(Ho) ortalama 0.14 olduğu, polimorfik bilgi içeriği (PIC) değerinin ise, ortalama 0.61 olduğu tespit

edilmiştir. Genetik benzerlik analizleri sonucu en yüksek benzerliğin L. culinaris subsp. orientalis ile L.

nigricans (%81) türleri arasında olduğu, en düşük benzerliğin ise L. ervoides ile L. nigricans (%10)

türleri arasında olduğu görülmüştür. Belirlenen aktarılabilir SSR markörlerinin tür içi veya türler arası

çalışmalara, genetik çeşitlilik, popülasyon yapısı, gen akışı, filogenetik ve evrimsel ilişkileri araştırmak

için yapılan çalışmalara katkı sağlayabileceği düşünülmektedir.