Akademik Veri Yönetim Sistemi
25. Ulusal Kimya Kongresi, 27 Haziran - 02 Temmuz 2011, Erzurum, Erzurum, Türkiye, 27 Haziran - 02 Temmuz 2011, ss.169, (Özet Bildiri)
Kanser, vücut hücrelerinin kontrolsüz şekilde üreyerek komşu dokuları işgal etmesi veya kaynağını aldığı organdan daha uzak bir yere kan ya da lenf yoluyla yayılması ile oluşan bir hastalıktır. Feniltransferaz (Ftase) inhibitörleri ise çeşitli kanser hastalıklarının tedavisinde kullanılan ajanlardır. Grubumuz tarafından geliştirilen, bir hibrit metot Elektron Konformasyonel Genetik Algoritma (ECGA) [1-2] metodu kullanılarak imidazol türevi [3] bileşiklerin biyolojik aktivitesinden sorumlu farmakofor grubun belirlenmesi ve nicel aktivite tahmini yapılmıştır. 46 bileşik için kuantum kimyasal hesaplamalar PM3 metodu kullanılarak yapıldıktan sonra yük, mesafe, bağ derecesi, kartezyen koordinatları ve konformasyon analiz bilgilerinden faydalanılarak serideki bileşiklerin bütün konformerleri için Elektron Konformasyonel Uygunluk Matrisleri (ECMC) hazırlanmıştır. ECSP (çalışma grubumuz tarafından geliştirilen farmakofor grubunu belirleme) programı kullanılarak ECMC’ler belirli tolerans değerleri içerisinde karşılaştırılarak imidazol bileşikleri için aktiviteden sorumlu farmakofor grubu bulunmuştur. 46 bileşik için inhibisyon aktivitelerine etki eden en önemli parametre gruplarının belirlenmesi ve teorik aktivite değerlerinin bulunması için EMRE yazılımı kullanılmıştır. Ayrıca bileşikler eğitim ve test seti olmak üzere ikiye ayrılarak optimizasyon uygulanmıştır. Eğitim setinden elde edilen moleküler parametreler kullanılarak test seti için biyoaktivite değerleri belirlenmiştir. Ayrıca EC-GA metodundan bulunan sonuçların, CoMFA ve CoMSIA metodları ile karşılaştırılması yapılmıştır. Şekilde imidazol serisinin en aktif bileşiğin şekli 3 boyutlu yapısı gösterilmiştir. (Görüntünün sade olması için hidrojenler gösterilmemiştir).