MORPHOLOGICAL, ANATOMIC AND MOLECULAR INVESTIGATION OF SOME LICHENIZED FUNGI BIODIVERSITY IN KIRIKHAN DISTRICT, HATAY


Ökten M. C., Halıcı M. G., Güllü M.

VI. HAGIA SOPHIA INTERNATIONAL CONFERENCE ON MULTIDISCIPLINARY SCIENTIFIC STUDIES, İstanbul, Turkey, 2 - 03 June 2023, pp.383-397

  • Publication Type: Conference Paper / Full Text
  • City: İstanbul
  • Country: Turkey
  • Page Numbers: pp.383-397
  • Erciyes University Affiliated: Yes

Abstract

In this study, we performed morphological, anatomical and molecular analyzes of some lichen samples collected from Kırıkhan district in Hatay. The external morphology was examined under a stereo microscope. The anatomy of the thallus and apothecia was examined under the light microscope. The shapes and sizes of ascus and ascospores were measured. DNA isolation was performed using the Qiagen DNeasy plant mini kit. PCR analysis was performed using ITS (ITS1 and ITS4) primers. Phylogenetic analyzes of the collected lichen samples were performed using the Maximum Likelihood method of the Mega 7 (Molecular Evolutionary Genetics Analysis) software program. Phylogenetic analyzes were performed by comparing samples obtained from ITS sequences and related samples from Gen Bank. Species identified morphologically and anatomically in this way were also confirmed molecularly. Species identified in this study are: Circinaria mansourii (Sohrabi) Sohrabi, Diplotomma venustum (Körb.) Körb., Flavoplaca oasis (A. Massal.) Arup, Frödén & Søchting, Lobothallia radiosa (Hoffm.) Hafellner, Physcia dubia (Hoffm.) Lettau, Sanguineodiscus haematites (Chaub. ex St.-Amans) I.V. Frolov & Vondrák.

Bu çalışmada Hatay’ın Kırıkhan ilçesinden toplanan bazı liken örneklerinin morfolojik, anatomik ve moleküler analizleri yapıldı. Dış morfoloji stereo mikroskop altında incelenmiştir. Tallus ve apotesyum anatomisi ise ışık mikroskobu altında incelendi. Askus ve askosporların şekilleri ve büyüklükleri ölçüldü. DNA izolasyonu Qiagen DNeasy bitki mini kiti kullanılarak gerçekleştirildi. ITS (ITS1 ve ITS4) primerleri kullanılarak PZR analizi yapıldı. Toplanan liken örneklerinin filogenetik analizleri Mega 7 (Molecular Evolutionary Genetics Analysis) yazılım programının Maximum Likelihood yöntemi kullanılarak yapıldı. ITS dizileri elde edilen örnekler ve Gen Bank’tan alınan ilişkili örneklerler karşılaştırılarak filogenetik analizleri gerçekleştirildi. Bu şekilde morfolojik ve anatomik olarak teşhis edilen türler moleküler olarak ta doğrulanmış oldu. Bu çalışma kapsamında belirlenen türler şunlardır: Circinaria mansourii (Sohrabi) Sohrabi, Diplotomma venustum (Körb.) Körb., Flavoplaca oasis (A. Massal.) Arup, Frödén & Søchting, Lobothallia radiosa (Hoffm.) Hafellner, Physcia dubia (Hoffm.) Lettau, Sanguineodiscus haematites (Chaub. ex St.-Amans) I.V. Frolov & Vondrák.