Clostridium Difficile Patojeninin DNA İzolasyonu, Saflaştırması ve Amplifikasyonu Olmadan QCM Sensör ile İnsan Dışkısı İçerisinde Genetik ve Toksijenik Tespiti
SOYLU M. Ç. (Yürütücü), YÜKSEL M. E., ATALAY M. A.
TÜBİTAK Projesi, 3501 - Ulusal Genç Araştırmacı Kariyer Geliştirme Programı, 2018 - 2020
- Proje Türü: TÜBİTAK Projesi
- Destek Programı: 3501 - Ulusal Genç Araştırmacı Kariyer Geliştirme Programı
- Başlama Tarihi: Mart 2018
- Bitiş Tarihi: Mart 2020
Proje Özeti
Clostridium difficile enfeksiyonu,
erken teşhis edilmediği ve uygun tedaviye başlanmadığı takdirde sağlık
problemlerine ve ölüme yol açabilen önemli bir enfeksiyondur. En uygun
teşhisin, bakterinin genetik ve toksijenik tespitiyle mümkün olduğu, ancak
böyle bir klinik tespit metodunun olmadığı, son yıllarda yapılan bilimsel
çalışmalarda vurgulanmaktadır. Bu çalışmada, Kuvars Kristal Mikroterazi sensör
ile aynı anda genetik ve toksijenik tespite imkân tanıyacak bir sistem
kurgulanmıştır. Sinyal/Gürültü oranı 3’ten büyük olacak şekilde tasarlanan
tespit sisteminin en uygun yüzey modifikasyonu 11-Mercaptoundecanoic asit
kaplama ajanının sağladığı görülmüştür. Model tespit ortamında genetik ve
toksijenik tespit için sistem optimize edilmiştir. Sistem, tcdB geni tespiti
için 105 CFU/ml ve toksin B antijeni tespiti için 0,1 ng/mL
hassasiyet sınırında çalışabilecek şekilde optimize edilmiştir. İnsan dışkısı
içerisinde yapılan tcdB geni ve toksin B deneyleri sonucunda, sistemin % 83,33
hassasiyet ve % 75 spesifisiteye sahip olduğu belirlenmiştir. PCR ve
immünokromatografik kart testi ile teyit edilen sonuçlara göre %95 güven
sınırında en düşük konsantrasyonlar olan 105 CFU/ml ve 0,1 ng/mL ve
bunların negatif kontrolleri arasında istatistiki anlamlı bir fark vardır.